Protein–RNA interactions for Protein: Q96L46

CAPNS2, Calpain small subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS2Q96L46 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPNS2Q96L46 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPNS2Q96L46 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPNS2Q96L46 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPNS2Q96L46 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPNS2Q96L46 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPNS2Q96L46 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPNS2Q96L46 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPNS2Q96L46 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPNS2Q96L46 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPNS2Q96L46 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPNS2Q96L46 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPNS2Q96L46 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPNS2Q96L46 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPNS2Q96L46 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPNS2Q96L46 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPNS2Q96L46 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPNS2Q96L46 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPNS2Q96L46 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPNS2Q96L46 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPNS2Q96L46 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPNS2Q96L46 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPNS2Q96L46 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPNS2Q96L46 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPNS2Q96L46 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPNS2Q96L46 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPNS2Q96L46 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPNS2Q96L46 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPNS2Q96L46 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPNS2Q96L46 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPNS2Q96L46 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPNS2Q96L46 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPNS2Q96L46 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPNS2Q96L46 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPNS2Q96L46 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPNS2Q96L46 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPNS2Q96L46 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPNS2Q96L46 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPNS2Q96L46 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPNS2Q96L46 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPNS2Q96L46 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPNS2Q96L46 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPNS2Q96L46 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPNS2Q96L46 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPNS2Q96L46 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPNS2Q96L46 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPNS2Q96L46 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPNS2Q96L46 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPNS2Q96L46 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPNS2Q96L46 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPNS2Q96L46 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPNS2Q96L46 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPNS2Q96L46 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPNS2Q96L46 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPNS2Q96L46 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPNS2Q96L46 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPNS2Q96L46 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPNS2Q96L46 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPNS2Q96L46 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPNS2Q96L46 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPNS2Q96L46 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPNS2Q96L46 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPNS2Q96L46 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPNS2Q96L46 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPNS2Q96L46 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPNS2Q96L46 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPNS2Q96L46 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPNS2Q96L46 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPNS2Q96L46 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPNS2Q96L46 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPNS2Q96L46 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPNS2Q96L46 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPNS2Q96L46 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPNS2Q96L46 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPNS2Q96L46 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPNS2Q96L46 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPNS2Q96L46 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPNS2Q96L46 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPNS2Q96L46 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPNS2Q96L46 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPNS2Q96L46 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPNS2Q96L46 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPNS2Q96L46 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPNS2Q96L46 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPNS2Q96L46 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPNS2Q96L46 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPNS2Q96L46 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPNS2Q96L46 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPNS2Q96L46 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPNS2Q96L46 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPNS2Q96L46 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPNS2Q96L46 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPNS2Q96L46 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPNS2Q96L46 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPNS2Q96L46 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPNS2Q96L46 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPNS2Q96L46 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPNS2Q96L46 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPNS2Q96L46 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPNS2Q96L46 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms