Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZBED3Q96IU2 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZBED3Q96IU2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZBED3Q96IU2 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZBED3Q96IU2 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZBED3Q96IU2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZBED3Q96IU2 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZBED3Q96IU2 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZBED3Q96IU2 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZBED3Q96IU2 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZBED3Q96IU2 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ZBED3Q96IU2 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ZBED3Q96IU2 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZBED3Q96IU2 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZBED3Q96IU2 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZBED3Q96IU2 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZBED3Q96IU2 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZBED3Q96IU2 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ZBED3Q96IU2 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZBED3Q96IU2 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZBED3Q96IU2 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZBED3Q96IU2 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZBED3Q96IU2 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZBED3Q96IU2 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZBED3Q96IU2 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ZBED3Q96IU2 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ZBED3Q96IU2 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZBED3Q96IU2 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZBED3Q96IU2 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZBED3Q96IU2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZBED3Q96IU2 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZBED3Q96IU2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZBED3Q96IU2 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZBED3Q96IU2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZBED3Q96IU2 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZBED3Q96IU2 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZBED3Q96IU2 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ZBED3Q96IU2 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZBED3Q96IU2 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZBED3Q96IU2 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZBED3Q96IU2 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZBED3Q96IU2 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ZBED3Q96IU2 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ZBED3Q96IU2 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZBED3Q96IU2 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZBED3Q96IU2 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZBED3Q96IU2 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZBED3Q96IU2 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZBED3Q96IU2 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ZBED3Q96IU2 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZBED3Q96IU2 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZBED3Q96IU2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZBED3Q96IU2 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZBED3Q96IU2 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZBED3Q96IU2 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZBED3Q96IU2 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZBED3Q96IU2 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZBED3Q96IU2 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZBED3Q96IU2 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZBED3Q96IU2 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZBED3Q96IU2 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ZBED3Q96IU2 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZBED3Q96IU2 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZBED3Q96IU2 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ZBED3Q96IU2 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ZBED3Q96IU2 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZBED3Q96IU2 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZBED3Q96IU2 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZBED3Q96IU2 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZBED3Q96IU2 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZBED3Q96IU2 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZBED3Q96IU2 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZBED3Q96IU2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZBED3Q96IU2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZBED3Q96IU2 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZBED3Q96IU2 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZBED3Q96IU2 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZBED3Q96IU2 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZBED3Q96IU2 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZBED3Q96IU2 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZBED3Q96IU2 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZBED3Q96IU2 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZBED3Q96IU2 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ZBED3Q96IU2 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZBED3Q96IU2 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZBED3Q96IU2 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ZBED3Q96IU2 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZBED3Q96IU2 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZBED3Q96IU2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZBED3Q96IU2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZBED3Q96IU2 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ZBED3Q96IU2 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZBED3Q96IU2 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZBED3Q96IU2 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZBED3Q96IU2 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZBED3Q96IU2 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZBED3Q96IU2 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZBED3Q96IU2 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZBED3Q96IU2 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZBED3Q96IU2 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
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