Protein–RNA interactions for Protein: Q93008

USP9X, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9XQ93008 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP9XQ93008 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms