Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC13□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC13□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
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COPS9Q8WXC6 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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