Protein–RNA interactions for Protein: Q6YHK3

CD109, CD109 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD109Q6YHK3 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CD109Q6YHK3 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CD109Q6YHK3 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CD109Q6YHK3 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CD109Q6YHK3 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CD109Q6YHK3 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CD109Q6YHK3 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CD109Q6YHK3 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CD109Q6YHK3 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CD109Q6YHK3 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CD109Q6YHK3 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CD109Q6YHK3 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CD109Q6YHK3 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CD109Q6YHK3 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CD109Q6YHK3 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CD109Q6YHK3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CD109Q6YHK3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CD109Q6YHK3 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CD109Q6YHK3 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CD109Q6YHK3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
CD109Q6YHK3 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CD109Q6YHK3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CD109Q6YHK3 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CD109Q6YHK3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CD109Q6YHK3 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CD109Q6YHK3 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CD109Q6YHK3 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CD109Q6YHK3 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CD109Q6YHK3 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
CD109Q6YHK3 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
CD109Q6YHK3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CD109Q6YHK3 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CD109Q6YHK3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CD109Q6YHK3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CD109Q6YHK3 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CD109Q6YHK3 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CD109Q6YHK3 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CD109Q6YHK3 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CD109Q6YHK3 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CD109Q6YHK3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CD109Q6YHK3 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CD109Q6YHK3 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CD109Q6YHK3 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CD109Q6YHK3 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CD109Q6YHK3 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CD109Q6YHK3 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CD109Q6YHK3 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CD109Q6YHK3 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CD109Q6YHK3 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CD109Q6YHK3 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CD109Q6YHK3 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CD109Q6YHK3 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CD109Q6YHK3 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CD109Q6YHK3 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CD109Q6YHK3 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CD109Q6YHK3 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CD109Q6YHK3 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CD109Q6YHK3 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
CD109Q6YHK3 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
CD109Q6YHK3 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CD109Q6YHK3 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CD109Q6YHK3 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CD109Q6YHK3 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
CD109Q6YHK3 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CD109Q6YHK3 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CD109Q6YHK3 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
CD109Q6YHK3 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CD109Q6YHK3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CD109Q6YHK3 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CD109Q6YHK3 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
CD109Q6YHK3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CD109Q6YHK3 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CD109Q6YHK3 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CD109Q6YHK3 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CD109Q6YHK3 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CD109Q6YHK3 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CD109Q6YHK3 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CD109Q6YHK3 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CD109Q6YHK3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CD109Q6YHK3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CD109Q6YHK3 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CD109Q6YHK3 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CD109Q6YHK3 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CD109Q6YHK3 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CD109Q6YHK3 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
CD109Q6YHK3 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
CD109Q6YHK3 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CD109Q6YHK3 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CD109Q6YHK3 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CD109Q6YHK3 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
CD109Q6YHK3 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CD109Q6YHK3 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CD109Q6YHK3 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CD109Q6YHK3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CD109Q6YHK3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CD109Q6YHK3 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CD109Q6YHK3 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CD109Q6YHK3 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CD109Q6YHK3 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CD109Q6YHK3 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms