Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWE0

LRSAM1, E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRSAM1Q6UWE0 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRSAM1Q6UWE0 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRSAM1Q6UWE0 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRSAM1Q6UWE0 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRSAM1Q6UWE0 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRSAM1Q6UWE0 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
LRSAM1Q6UWE0 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRSAM1Q6UWE0 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
LRSAM1Q6UWE0 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRSAM1Q6UWE0 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRSAM1Q6UWE0 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRSAM1Q6UWE0 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRSAM1Q6UWE0 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRSAM1Q6UWE0 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRSAM1Q6UWE0 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRSAM1Q6UWE0 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRSAM1Q6UWE0 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRSAM1Q6UWE0 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRSAM1Q6UWE0 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRSAM1Q6UWE0 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRSAM1Q6UWE0 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRSAM1Q6UWE0 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRSAM1Q6UWE0 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRSAM1Q6UWE0 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRSAM1Q6UWE0 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRSAM1Q6UWE0 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRSAM1Q6UWE0 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
LRSAM1Q6UWE0 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
LRSAM1Q6UWE0 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRSAM1Q6UWE0 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRSAM1Q6UWE0 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRSAM1Q6UWE0 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
LRSAM1Q6UWE0 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRSAM1Q6UWE0 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRSAM1Q6UWE0 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRSAM1Q6UWE0 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRSAM1Q6UWE0 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRSAM1Q6UWE0 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRSAM1Q6UWE0 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRSAM1Q6UWE0 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRSAM1Q6UWE0 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRSAM1Q6UWE0 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRSAM1Q6UWE0 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRSAM1Q6UWE0 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRSAM1Q6UWE0 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRSAM1Q6UWE0 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRSAM1Q6UWE0 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRSAM1Q6UWE0 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRSAM1Q6UWE0 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRSAM1Q6UWE0 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRSAM1Q6UWE0 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRSAM1Q6UWE0 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRSAM1Q6UWE0 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRSAM1Q6UWE0 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRSAM1Q6UWE0 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
LRSAM1Q6UWE0 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRSAM1Q6UWE0 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
LRSAM1Q6UWE0 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRSAM1Q6UWE0 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRSAM1Q6UWE0 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRSAM1Q6UWE0 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRSAM1Q6UWE0 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRSAM1Q6UWE0 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRSAM1Q6UWE0 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRSAM1Q6UWE0 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRSAM1Q6UWE0 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRSAM1Q6UWE0 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
LRSAM1Q6UWE0 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRSAM1Q6UWE0 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRSAM1Q6UWE0 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRSAM1Q6UWE0 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRSAM1Q6UWE0 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRSAM1Q6UWE0 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRSAM1Q6UWE0 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRSAM1Q6UWE0 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LRSAM1Q6UWE0 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRSAM1Q6UWE0 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LRSAM1Q6UWE0 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRSAM1Q6UWE0 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRSAM1Q6UWE0 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRSAM1Q6UWE0 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRSAM1Q6UWE0 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRSAM1Q6UWE0 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRSAM1Q6UWE0 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRSAM1Q6UWE0 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRSAM1Q6UWE0 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRSAM1Q6UWE0 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRSAM1Q6UWE0 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRSAM1Q6UWE0 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRSAM1Q6UWE0 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRSAM1Q6UWE0 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRSAM1Q6UWE0 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LRSAM1Q6UWE0 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRSAM1Q6UWE0 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LRSAM1Q6UWE0 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LRSAM1Q6UWE0 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LRSAM1Q6UWE0 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRSAM1Q6UWE0 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRSAM1Q6UWE0 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRSAM1Q6UWE0 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms