Protein–RNA interactions for Protein: Q6L8Q7

PDE12, 2',5'-phosphodiesterase 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE12Q6L8Q7 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE12Q6L8Q7 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE12Q6L8Q7 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE12Q6L8Q7 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE12Q6L8Q7 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE12Q6L8Q7 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE12Q6L8Q7 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE12Q6L8Q7 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE12Q6L8Q7 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE12Q6L8Q7 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE12Q6L8Q7 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE12Q6L8Q7 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE12Q6L8Q7 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE12Q6L8Q7 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE12Q6L8Q7 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE12Q6L8Q7 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE12Q6L8Q7 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE12Q6L8Q7 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE12Q6L8Q7 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE12Q6L8Q7 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE12Q6L8Q7 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PDE12Q6L8Q7 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PDE12Q6L8Q7 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PDE12Q6L8Q7 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PDE12Q6L8Q7 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE12Q6L8Q7 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE12Q6L8Q7 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE12Q6L8Q7 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE12Q6L8Q7 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE12Q6L8Q7 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE12Q6L8Q7 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE12Q6L8Q7 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE12Q6L8Q7 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE12Q6L8Q7 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE12Q6L8Q7 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE12Q6L8Q7 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE12Q6L8Q7 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE12Q6L8Q7 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE12Q6L8Q7 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE12Q6L8Q7 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE12Q6L8Q7 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE12Q6L8Q7 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE12Q6L8Q7 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE12Q6L8Q7 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE12Q6L8Q7 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE12Q6L8Q7 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE12Q6L8Q7 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE12Q6L8Q7 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE12Q6L8Q7 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE12Q6L8Q7 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE12Q6L8Q7 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE12Q6L8Q7 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE12Q6L8Q7 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE12Q6L8Q7 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE12Q6L8Q7 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE12Q6L8Q7 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE12Q6L8Q7 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE12Q6L8Q7 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE12Q6L8Q7 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE12Q6L8Q7 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE12Q6L8Q7 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE12Q6L8Q7 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE12Q6L8Q7 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE12Q6L8Q7 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE12Q6L8Q7 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE12Q6L8Q7 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE12Q6L8Q7 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE12Q6L8Q7 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE12Q6L8Q7 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE12Q6L8Q7 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE12Q6L8Q7 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE12Q6L8Q7 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE12Q6L8Q7 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE12Q6L8Q7 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE12Q6L8Q7 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE12Q6L8Q7 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE12Q6L8Q7 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE12Q6L8Q7 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE12Q6L8Q7 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE12Q6L8Q7 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE12Q6L8Q7 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE12Q6L8Q7 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE12Q6L8Q7 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE12Q6L8Q7 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE12Q6L8Q7 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE12Q6L8Q7 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE12Q6L8Q7 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE12Q6L8Q7 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE12Q6L8Q7 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE12Q6L8Q7 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE12Q6L8Q7 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE12Q6L8Q7 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE12Q6L8Q7 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE12Q6L8Q7 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE12Q6L8Q7 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE12Q6L8Q7 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE12Q6L8Q7 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE12Q6L8Q7 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE12Q6L8Q7 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE12Q6L8Q7 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms