Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0Q7

USPL1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, humanhuman

Predictions only

Length 1,092 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USPL1Q5W0Q7 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USPL1Q5W0Q7 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USPL1Q5W0Q7 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
USPL1Q5W0Q7 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USPL1Q5W0Q7 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USPL1Q5W0Q7 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USPL1Q5W0Q7 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USPL1Q5W0Q7 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USPL1Q5W0Q7 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USPL1Q5W0Q7 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USPL1Q5W0Q7 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USPL1Q5W0Q7 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USPL1Q5W0Q7 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USPL1Q5W0Q7 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USPL1Q5W0Q7 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USPL1Q5W0Q7 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USPL1Q5W0Q7 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USPL1Q5W0Q7 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USPL1Q5W0Q7 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USPL1Q5W0Q7 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USPL1Q5W0Q7 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USPL1Q5W0Q7 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USPL1Q5W0Q7 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USPL1Q5W0Q7 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USPL1Q5W0Q7 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USPL1Q5W0Q7 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USPL1Q5W0Q7 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USPL1Q5W0Q7 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USPL1Q5W0Q7 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USPL1Q5W0Q7 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USPL1Q5W0Q7 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USPL1Q5W0Q7 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USPL1Q5W0Q7 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USPL1Q5W0Q7 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USPL1Q5W0Q7 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USPL1Q5W0Q7 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USPL1Q5W0Q7 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USPL1Q5W0Q7 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USPL1Q5W0Q7 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USPL1Q5W0Q7 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USPL1Q5W0Q7 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USPL1Q5W0Q7 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USPL1Q5W0Q7 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USPL1Q5W0Q7 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USPL1Q5W0Q7 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USPL1Q5W0Q7 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USPL1Q5W0Q7 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USPL1Q5W0Q7 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USPL1Q5W0Q7 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USPL1Q5W0Q7 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USPL1Q5W0Q7 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USPL1Q5W0Q7 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USPL1Q5W0Q7 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USPL1Q5W0Q7 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USPL1Q5W0Q7 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USPL1Q5W0Q7 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USPL1Q5W0Q7 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
USPL1Q5W0Q7 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USPL1Q5W0Q7 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USPL1Q5W0Q7 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USPL1Q5W0Q7 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
USPL1Q5W0Q7 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
USPL1Q5W0Q7 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USPL1Q5W0Q7 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USPL1Q5W0Q7 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USPL1Q5W0Q7 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USPL1Q5W0Q7 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USPL1Q5W0Q7 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USPL1Q5W0Q7 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USPL1Q5W0Q7 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USPL1Q5W0Q7 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USPL1Q5W0Q7 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USPL1Q5W0Q7 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USPL1Q5W0Q7 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USPL1Q5W0Q7 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USPL1Q5W0Q7 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USPL1Q5W0Q7 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USPL1Q5W0Q7 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USPL1Q5W0Q7 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
USPL1Q5W0Q7 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
USPL1Q5W0Q7 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USPL1Q5W0Q7 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
USPL1Q5W0Q7 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USPL1Q5W0Q7 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USPL1Q5W0Q7 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USPL1Q5W0Q7 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USPL1Q5W0Q7 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
USPL1Q5W0Q7 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USPL1Q5W0Q7 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USPL1Q5W0Q7 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USPL1Q5W0Q7 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USPL1Q5W0Q7 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USPL1Q5W0Q7 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USPL1Q5W0Q7 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USPL1Q5W0Q7 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USPL1Q5W0Q7 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USPL1Q5W0Q7 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USPL1Q5W0Q7 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USPL1Q5W0Q7 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
USPL1Q5W0Q7 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms