Protein–RNA interactions for Protein: Q49AN0

CRY2, Cryptochrome-2, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY2Q49AN0 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRY2Q49AN0 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRY2Q49AN0 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRY2Q49AN0 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRY2Q49AN0 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRY2Q49AN0 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRY2Q49AN0 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRY2Q49AN0 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRY2Q49AN0 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRY2Q49AN0 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CRY2Q49AN0 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRY2Q49AN0 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRY2Q49AN0 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRY2Q49AN0 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRY2Q49AN0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRY2Q49AN0 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRY2Q49AN0 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CRY2Q49AN0 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRY2Q49AN0 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRY2Q49AN0 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRY2Q49AN0 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRY2Q49AN0 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRY2Q49AN0 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRY2Q49AN0 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRY2Q49AN0 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRY2Q49AN0 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRY2Q49AN0 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CRY2Q49AN0 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CRY2Q49AN0 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRY2Q49AN0 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRY2Q49AN0 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRY2Q49AN0 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRY2Q49AN0 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRY2Q49AN0 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRY2Q49AN0 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRY2Q49AN0 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRY2Q49AN0 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CRY2Q49AN0 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRY2Q49AN0 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRY2Q49AN0 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CRY2Q49AN0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRY2Q49AN0 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRY2Q49AN0 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRY2Q49AN0 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRY2Q49AN0 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRY2Q49AN0 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRY2Q49AN0 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRY2Q49AN0 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRY2Q49AN0 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRY2Q49AN0 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CRY2Q49AN0 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRY2Q49AN0 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRY2Q49AN0 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CRY2Q49AN0 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CRY2Q49AN0 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CRY2Q49AN0 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CRY2Q49AN0 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CRY2Q49AN0 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CRY2Q49AN0 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CRY2Q49AN0 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CRY2Q49AN0 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CRY2Q49AN0 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CRY2Q49AN0 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CRY2Q49AN0 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CRY2Q49AN0 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CRY2Q49AN0 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CRY2Q49AN0 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CRY2Q49AN0 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRY2Q49AN0 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRY2Q49AN0 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRY2Q49AN0 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRY2Q49AN0 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRY2Q49AN0 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRY2Q49AN0 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRY2Q49AN0 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRY2Q49AN0 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CRY2Q49AN0 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRY2Q49AN0 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CRY2Q49AN0 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRY2Q49AN0 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRY2Q49AN0 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRY2Q49AN0 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CRY2Q49AN0 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CRY2Q49AN0 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRY2Q49AN0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRY2Q49AN0 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRY2Q49AN0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRY2Q49AN0 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRY2Q49AN0 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRY2Q49AN0 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRY2Q49AN0 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRY2Q49AN0 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRY2Q49AN0 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRY2Q49AN0 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRY2Q49AN0 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRY2Q49AN0 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRY2Q49AN0 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRY2Q49AN0 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRY2Q49AN0 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRY2Q49AN0 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms