Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
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