Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms