Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ALCAMQ13740 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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