Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

Predictions only

Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATRQ13535 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATRQ13535 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATRQ13535 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ATRQ13535 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATRQ13535 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATRQ13535 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ATRQ13535 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATRQ13535 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATRQ13535 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATRQ13535 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATRQ13535 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATRQ13535 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ATRQ13535 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATRQ13535 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATRQ13535 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATRQ13535 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATRQ13535 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATRQ13535 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATRQ13535 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATRQ13535 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATRQ13535 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATRQ13535 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATRQ13535 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATRQ13535 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATRQ13535 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATRQ13535 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATRQ13535 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATRQ13535 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATRQ13535 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATRQ13535 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATRQ13535 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATRQ13535 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATRQ13535 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATRQ13535 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATRQ13535 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATRQ13535 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATRQ13535 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATRQ13535 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ATRQ13535 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATRQ13535 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATRQ13535 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATRQ13535 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATRQ13535 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATRQ13535 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATRQ13535 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATRQ13535 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATRQ13535 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATRQ13535 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATRQ13535 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATRQ13535 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATRQ13535 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ATRQ13535 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATRQ13535 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ATRQ13535 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATRQ13535 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATRQ13535 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATRQ13535 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATRQ13535 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATRQ13535 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATRQ13535 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATRQ13535 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATRQ13535 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATRQ13535 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATRQ13535 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATRQ13535 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATRQ13535 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATRQ13535 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ATRQ13535 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATRQ13535 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ATRQ13535 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ATRQ13535 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ATRQ13535 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ATRQ13535 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATRQ13535 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATRQ13535 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATRQ13535 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATRQ13535 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATRQ13535 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATRQ13535 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATRQ13535 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATRQ13535 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATRQ13535 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATRQ13535 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATRQ13535 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATRQ13535 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATRQ13535 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ATRQ13535 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ATRQ13535 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATRQ13535 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ATRQ13535 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATRQ13535 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATRQ13535 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATRQ13535 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATRQ13535 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATRQ13535 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATRQ13535 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATRQ13535 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATRQ13535 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATRQ13535 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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