Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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PTPN13Q12923 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
PTPN13Q12923 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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