Protein–RNA interactions for Protein: Q07889

SOS1, Son of sevenless homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOS1Q07889 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SOS1Q07889 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SOS1Q07889 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SOS1Q07889 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SOS1Q07889 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SOS1Q07889 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SOS1Q07889 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SOS1Q07889 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SOS1Q07889 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SOS1Q07889 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SOS1Q07889 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SOS1Q07889 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SOS1Q07889 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SOS1Q07889 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SOS1Q07889 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SOS1Q07889 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SOS1Q07889 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SOS1Q07889 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SOS1Q07889 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SOS1Q07889 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SOS1Q07889 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SOS1Q07889 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SOS1Q07889 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SOS1Q07889 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SOS1Q07889 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SOS1Q07889 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SOS1Q07889 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SOS1Q07889 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SOS1Q07889 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SOS1Q07889 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SOS1Q07889 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SOS1Q07889 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SOS1Q07889 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SOS1Q07889 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SOS1Q07889 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SOS1Q07889 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SOS1Q07889 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SOS1Q07889 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SOS1Q07889 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SOS1Q07889 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SOS1Q07889 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SOS1Q07889 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SOS1Q07889 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SOS1Q07889 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SOS1Q07889 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SOS1Q07889 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SOS1Q07889 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SOS1Q07889 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SOS1Q07889 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SOS1Q07889 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SOS1Q07889 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SOS1Q07889 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SOS1Q07889 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SOS1Q07889 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SOS1Q07889 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SOS1Q07889 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SOS1Q07889 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SOS1Q07889 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SOS1Q07889 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SOS1Q07889 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SOS1Q07889 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SOS1Q07889 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SOS1Q07889 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SOS1Q07889 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SOS1Q07889 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SOS1Q07889 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SOS1Q07889 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SOS1Q07889 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SOS1Q07889 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SOS1Q07889 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SOS1Q07889 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SOS1Q07889 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SOS1Q07889 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SOS1Q07889 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SOS1Q07889 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SOS1Q07889 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SOS1Q07889 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SOS1Q07889 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SOS1Q07889 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SOS1Q07889 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SOS1Q07889 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SOS1Q07889 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SOS1Q07889 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SOS1Q07889 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SOS1Q07889 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SOS1Q07889 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SOS1Q07889 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SOS1Q07889 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SOS1Q07889 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SOS1Q07889 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SOS1Q07889 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SOS1Q07889 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SOS1Q07889 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SOS1Q07889 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SOS1Q07889 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SOS1Q07889 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SOS1Q07889 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SOS1Q07889 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SOS1Q07889 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SOS1Q07889 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms