Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 AL049835.1-201ENST00000555850 514 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 MT1L-201ENST00000565768 411 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNB1Q02641 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 PYM1-202ENST00000398213 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 MYO16-AS2-201ENST00000412809 436 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 AC026353.1-201ENST00000470523 558 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 LINC02429-202ENST00000513836 694 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 LINC01216-201ENST00000515728 824 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 AC004852.2-204ENST00000614137 1370 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 LINC01468-201ENST00000422763 570 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 OR4A18P-201ENST00000529103 1088 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 AC011447.3-205ENST00000592022 1268 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 AL157762.1-201ENST00000619612 415 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 TMEM126A-201ENST00000304511 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 CARD8-211ENST00000519332 500 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 CARD8-224ENST00000522431 622 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 ACYP1-204ENST00000555135 639 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 AC091057.3-201ENST00000602684 733 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 AC006386.1-201ENST00000619436 415 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms