Protein–RNA interactions for Protein: Q00262

Stx2, Syntaxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx2Q00262 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms