Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
SMARCA2P51531 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
SMARCA2P51531 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
SMARCA2P51531 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
SMARCA2P51531 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
SMARCA2P51531 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
SMARCA2P51531 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
SMARCA2P51531 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
SMARCA2P51531 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
SMARCA2P51531 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
SMARCA2P51531 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
SMARCA2P51531 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
SMARCA2P51531 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
SMARCA2P51531 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
SMARCA2P51531 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
SMARCA2P51531 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
SMARCA2P51531 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
SMARCA2P51531 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
SMARCA2P51531 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
SMARCA2P51531 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
SMARCA2P51531 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
SMARCA2P51531 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
SMARCA2P51531 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
SMARCA2P51531 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
SMARCA2P51531 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
SMARCA2P51531 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
SMARCA2P51531 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
SMARCA2P51531 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
SMARCA2P51531 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
SMARCA2P51531 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
SMARCA2P51531 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
SMARCA2P51531 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
SMARCA2P51531 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
SMARCA2P51531 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
SMARCA2P51531 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
SMARCA2P51531 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
SMARCA2P51531 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
SMARCA2P51531 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
SMARCA2P51531 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
SMARCA2P51531 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
SMARCA2P51531 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
SMARCA2P51531 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
SMARCA2P51531 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
SMARCA2P51531 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
SMARCA2P51531 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
SMARCA2P51531 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
SMARCA2P51531 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
SMARCA2P51531 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
SMARCA2P51531 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
SMARCA2P51531 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
SMARCA2P51531 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
SMARCA2P51531 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
SMARCA2P51531 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
SMARCA2P51531 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
SMARCA2P51531 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
SMARCA2P51531 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
SMARCA2P51531 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
SMARCA2P51531 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
SMARCA2P51531 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
SMARCA2P51531 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
SMARCA2P51531 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
SMARCA2P51531 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
SMARCA2P51531 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
SMARCA2P51531 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
SMARCA2P51531 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
SMARCA2P51531 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
SMARCA2P51531 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
SMARCA2P51531 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
SMARCA2P51531 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
SMARCA2P51531 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
SMARCA2P51531 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC34.18■■■■□ 3.06
SMARCA2P51531 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
SMARCA2P51531 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
SMARCA2P51531 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
SMARCA2P51531 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
SMARCA2P51531 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
SMARCA2P51531 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
SMARCA2P51531 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
SMARCA2P51531 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
SMARCA2P51531 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
SMARCA2P51531 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.17■■■■□ 3.06
SMARCA2P51531 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
SMARCA2P51531 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
SMARCA2P51531 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
SMARCA2P51531 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
SMARCA2P51531 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
SMARCA2P51531 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
SMARCA2P51531 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
SMARCA2P51531 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
SMARCA2P51531 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
SMARCA2P51531 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
SMARCA2P51531 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
SMARCA2P51531 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
SMARCA2P51531 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
SMARCA2P51531 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
SMARCA2P51531 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
SMARCA2P51531 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
SMARCA2P51531 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
SMARCA2P51531 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
SMARCA2P51531 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms