Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSEN1P49768 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSEN1P49768 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSEN1P49768 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSEN1P49768 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSEN1P49768 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSEN1P49768 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSEN1P49768 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PSEN1P49768 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PSEN1P49768 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSEN1P49768 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PSEN1P49768 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSEN1P49768 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSEN1P49768 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSEN1P49768 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSEN1P49768 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSEN1P49768 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSEN1P49768 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSEN1P49768 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSEN1P49768 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSEN1P49768 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSEN1P49768 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSEN1P49768 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSEN1P49768 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSEN1P49768 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSEN1P49768 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PSEN1P49768 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSEN1P49768 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSEN1P49768 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSEN1P49768 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSEN1P49768 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSEN1P49768 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSEN1P49768 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSEN1P49768 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSEN1P49768 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSEN1P49768 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSEN1P49768 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSEN1P49768 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSEN1P49768 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSEN1P49768 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSEN1P49768 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSEN1P49768 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSEN1P49768 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSEN1P49768 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSEN1P49768 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSEN1P49768 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSEN1P49768 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSEN1P49768 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSEN1P49768 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSEN1P49768 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSEN1P49768 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSEN1P49768 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSEN1P49768 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSEN1P49768 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSEN1P49768 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSEN1P49768 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSEN1P49768 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSEN1P49768 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSEN1P49768 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSEN1P49768 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSEN1P49768 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSEN1P49768 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSEN1P49768 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSEN1P49768 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSEN1P49768 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSEN1P49768 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSEN1P49768 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSEN1P49768 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PSEN1P49768 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSEN1P49768 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSEN1P49768 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSEN1P49768 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSEN1P49768 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSEN1P49768 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSEN1P49768 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSEN1P49768 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSEN1P49768 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSEN1P49768 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSEN1P49768 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSEN1P49768 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSEN1P49768 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSEN1P49768 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSEN1P49768 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSEN1P49768 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PSEN1P49768 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSEN1P49768 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSEN1P49768 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSEN1P49768 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSEN1P49768 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSEN1P49768 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSEN1P49768 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSEN1P49768 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSEN1P49768 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSEN1P49768 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSEN1P49768 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSEN1P49768 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSEN1P49768 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSEN1P49768 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSEN1P49768 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSEN1P49768 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms