Protein–RNA interactions for Protein: P49765

VEGFB, Vascular endothelial growth factor B, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFBP49765 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VEGFBP49765 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
VEGFBP49765 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VEGFBP49765 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VEGFBP49765 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VEGFBP49765 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VEGFBP49765 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VEGFBP49765 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
VEGFBP49765 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VEGFBP49765 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VEGFBP49765 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VEGFBP49765 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VEGFBP49765 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VEGFBP49765 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VEGFBP49765 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VEGFBP49765 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VEGFBP49765 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VEGFBP49765 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VEGFBP49765 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VEGFBP49765 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VEGFBP49765 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VEGFBP49765 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VEGFBP49765 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VEGFBP49765 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VEGFBP49765 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VEGFBP49765 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VEGFBP49765 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VEGFBP49765 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VEGFBP49765 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VEGFBP49765 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VEGFBP49765 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VEGFBP49765 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VEGFBP49765 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VEGFBP49765 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VEGFBP49765 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VEGFBP49765 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VEGFBP49765 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VEGFBP49765 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VEGFBP49765 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VEGFBP49765 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
VEGFBP49765 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
VEGFBP49765 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VEGFBP49765 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VEGFBP49765 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
VEGFBP49765 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VEGFBP49765 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VEGFBP49765 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
VEGFBP49765 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
VEGFBP49765 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VEGFBP49765 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VEGFBP49765 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VEGFBP49765 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VEGFBP49765 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VEGFBP49765 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VEGFBP49765 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VEGFBP49765 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VEGFBP49765 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VEGFBP49765 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VEGFBP49765 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VEGFBP49765 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VEGFBP49765 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VEGFBP49765 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
VEGFBP49765 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VEGFBP49765 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VEGFBP49765 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VEGFBP49765 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms