Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
USP5P45974 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP5P45974 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP5P45974 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP5P45974 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP5P45974 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP5P45974 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP5P45974 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP5P45974 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP5P45974 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
USP5P45974 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP5P45974 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP5P45974 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP5P45974 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP5P45974 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP5P45974 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP5P45974 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP5P45974 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP5P45974 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP5P45974 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP5P45974 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP5P45974 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP5P45974 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP5P45974 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP5P45974 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP5P45974 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP5P45974 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
USP5P45974 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP5P45974 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP5P45974 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP5P45974 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP5P45974 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP5P45974 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP5P45974 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP5P45974 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP5P45974 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP5P45974 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP5P45974 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP5P45974 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP5P45974 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP5P45974 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP5P45974 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP5P45974 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP5P45974 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP5P45974 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP5P45974 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP5P45974 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP5P45974 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP5P45974 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP5P45974 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP5P45974 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP5P45974 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP5P45974 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP5P45974 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP5P45974 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP5P45974 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP5P45974 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP5P45974 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP5P45974 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP5P45974 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP5P45974 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP5P45974 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
USP5P45974 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP5P45974 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP5P45974 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP5P45974 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP5P45974 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP5P45974 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP5P45974 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP5P45974 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP5P45974 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP5P45974 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP5P45974 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP5P45974 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP5P45974 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP5P45974 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP5P45974 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP5P45974 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP5P45974 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
USP5P45974 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP5P45974 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
USP5P45974 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP5P45974 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP5P45974 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP5P45974 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP5P45974 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP5P45974 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP5P45974 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP5P45974 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP5P45974 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP5P45974 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP5P45974 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP5P45974 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP5P45974 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP5P45974 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP5P45974 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP5P45974 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP5P45974 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP5P45974 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP5P45974 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms