Protein–RNA interactions for Protein: P35249

RFC4, Replication factor C subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC4P35249 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RFC4P35249 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RFC4P35249 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RFC4P35249 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RFC4P35249 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RFC4P35249 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RFC4P35249 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RFC4P35249 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RFC4P35249 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RFC4P35249 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RFC4P35249 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RFC4P35249 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RFC4P35249 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RFC4P35249 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RFC4P35249 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RFC4P35249 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RFC4P35249 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RFC4P35249 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RFC4P35249 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RFC4P35249 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RFC4P35249 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RFC4P35249 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RFC4P35249 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RFC4P35249 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RFC4P35249 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RFC4P35249 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RFC4P35249 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RFC4P35249 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RFC4P35249 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RFC4P35249 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RFC4P35249 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RFC4P35249 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RFC4P35249 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RFC4P35249 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RFC4P35249 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RFC4P35249 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RFC4P35249 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RFC4P35249 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RFC4P35249 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RFC4P35249 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RFC4P35249 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RFC4P35249 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RFC4P35249 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RFC4P35249 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RFC4P35249 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RFC4P35249 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RFC4P35249 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RFC4P35249 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RFC4P35249 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RFC4P35249 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RFC4P35249 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RFC4P35249 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RFC4P35249 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RFC4P35249 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RFC4P35249 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RFC4P35249 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RFC4P35249 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RFC4P35249 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RFC4P35249 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RFC4P35249 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RFC4P35249 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RFC4P35249 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RFC4P35249 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RFC4P35249 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RFC4P35249 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RFC4P35249 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RFC4P35249 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RFC4P35249 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RFC4P35249 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RFC4P35249 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RFC4P35249 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RFC4P35249 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RFC4P35249 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RFC4P35249 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RFC4P35249 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RFC4P35249 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RFC4P35249 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RFC4P35249 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RFC4P35249 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RFC4P35249 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RFC4P35249 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RFC4P35249 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RFC4P35249 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RFC4P35249 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RFC4P35249 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RFC4P35249 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RFC4P35249 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RFC4P35249 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RFC4P35249 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RFC4P35249 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RFC4P35249 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RFC4P35249 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RFC4P35249 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RFC4P35249 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RFC4P35249 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RFC4P35249 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RFC4P35249 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RFC4P35249 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RFC4P35249 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RFC4P35249 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77 ms