Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SSFA2P28290 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SSFA2P28290 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SSFA2P28290 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SSFA2P28290 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SSFA2P28290 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SSFA2P28290 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SSFA2P28290 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SSFA2P28290 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SSFA2P28290 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SSFA2P28290 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SSFA2P28290 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SSFA2P28290 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SSFA2P28290 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SSFA2P28290 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SSFA2P28290 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SSFA2P28290 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SSFA2P28290 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SSFA2P28290 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SSFA2P28290 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SSFA2P28290 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SSFA2P28290 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SSFA2P28290 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SSFA2P28290 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SSFA2P28290 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SSFA2P28290 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SSFA2P28290 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SSFA2P28290 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SSFA2P28290 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SSFA2P28290 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SSFA2P28290 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SSFA2P28290 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SSFA2P28290 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SSFA2P28290 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SSFA2P28290 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SSFA2P28290 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SSFA2P28290 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SSFA2P28290 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SSFA2P28290 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SSFA2P28290 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SSFA2P28290 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SSFA2P28290 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SSFA2P28290 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SSFA2P28290 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SSFA2P28290 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SSFA2P28290 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SSFA2P28290 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SSFA2P28290 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SSFA2P28290 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SSFA2P28290 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SSFA2P28290 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SSFA2P28290 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SSFA2P28290 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SSFA2P28290 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SSFA2P28290 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SSFA2P28290 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SSFA2P28290 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SSFA2P28290 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SSFA2P28290 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SSFA2P28290 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SSFA2P28290 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SSFA2P28290 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SSFA2P28290 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SSFA2P28290 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SSFA2P28290 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SSFA2P28290 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SSFA2P28290 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SSFA2P28290 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SSFA2P28290 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SSFA2P28290 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SSFA2P28290 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SSFA2P28290 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SSFA2P28290 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SSFA2P28290 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
SSFA2P28290 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SSFA2P28290 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SSFA2P28290 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SSFA2P28290 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SSFA2P28290 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SSFA2P28290 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SSFA2P28290 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SSFA2P28290 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SSFA2P28290 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SSFA2P28290 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SSFA2P28290 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SSFA2P28290 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SSFA2P28290 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SSFA2P28290 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SSFA2P28290 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SSFA2P28290 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SSFA2P28290 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SSFA2P28290 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SSFA2P28290 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SSFA2P28290 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SSFA2P28290 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SSFA2P28290 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SSFA2P28290 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SSFA2P28290 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SSFA2P28290 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SSFA2P28290 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms