Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HTR2AP28223 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms