Protein–RNA interactions for Protein: P27448

MARK3, MAP/microtubule affinity-regulating kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARK3P27448 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MARK3P27448 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MARK3P27448 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MARK3P27448 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MARK3P27448 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MARK3P27448 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MARK3P27448 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MARK3P27448 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MARK3P27448 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MARK3P27448 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MARK3P27448 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MARK3P27448 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MARK3P27448 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MARK3P27448 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MARK3P27448 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MARK3P27448 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MARK3P27448 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MARK3P27448 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MARK3P27448 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MARK3P27448 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MARK3P27448 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MARK3P27448 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MARK3P27448 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MARK3P27448 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MARK3P27448 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MARK3P27448 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MARK3P27448 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MARK3P27448 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MARK3P27448 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MARK3P27448 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MARK3P27448 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MARK3P27448 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MARK3P27448 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MARK3P27448 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MARK3P27448 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MARK3P27448 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MARK3P27448 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MARK3P27448 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MARK3P27448 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MARK3P27448 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MARK3P27448 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MARK3P27448 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MARK3P27448 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MARK3P27448 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MARK3P27448 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MARK3P27448 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
MARK3P27448 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
MARK3P27448 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MARK3P27448 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MARK3P27448 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MARK3P27448 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MARK3P27448 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MARK3P27448 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MARK3P27448 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MARK3P27448 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MARK3P27448 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MARK3P27448 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MARK3P27448 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MARK3P27448 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MARK3P27448 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MARK3P27448 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MARK3P27448 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MARK3P27448 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MARK3P27448 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MARK3P27448 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MARK3P27448 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MARK3P27448 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MARK3P27448 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MARK3P27448 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MARK3P27448 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MARK3P27448 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MARK3P27448 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MARK3P27448 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MARK3P27448 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MARK3P27448 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MARK3P27448 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MARK3P27448 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MARK3P27448 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MARK3P27448 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MARK3P27448 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MARK3P27448 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MARK3P27448 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MARK3P27448 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MARK3P27448 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MARK3P27448 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MARK3P27448 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MARK3P27448 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MARK3P27448 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MARK3P27448 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MARK3P27448 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MARK3P27448 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MARK3P27448 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MARK3P27448 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MARK3P27448 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MARK3P27448 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MARK3P27448 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MARK3P27448 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
MARK3P27448 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MARK3P27448 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
MARK3P27448 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms