Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTSSP25774 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTSSP25774 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTSSP25774 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTSSP25774 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTSSP25774 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTSSP25774 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CTSSP25774 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTSSP25774 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTSSP25774 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTSSP25774 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTSSP25774 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTSSP25774 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CTSSP25774 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CTSSP25774 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTSSP25774 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTSSP25774 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTSSP25774 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTSSP25774 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTSSP25774 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTSSP25774 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CTSSP25774 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTSSP25774 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTSSP25774 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTSSP25774 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CTSSP25774 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTSSP25774 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTSSP25774 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTSSP25774 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CTSSP25774 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTSSP25774 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CTSSP25774 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTSSP25774 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CTSSP25774 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTSSP25774 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTSSP25774 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTSSP25774 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTSSP25774 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTSSP25774 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTSSP25774 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTSSP25774 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTSSP25774 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTSSP25774 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSSP25774 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSSP25774 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSSP25774 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSSP25774 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSSP25774 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSSP25774 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSSP25774 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSSP25774 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSSP25774 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSSP25774 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSSP25774 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSSP25774 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSSP25774 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSSP25774 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSSP25774 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSSP25774 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSSP25774 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSSP25774 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSSP25774 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSSP25774 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSSP25774 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSSP25774 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSSP25774 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSSP25774 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSSP25774 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSSP25774 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSSP25774 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSSP25774 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSSP25774 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSSP25774 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSSP25774 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSSP25774 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSSP25774 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSSP25774 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSSP25774 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSSP25774 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSSP25774 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSSP25774 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSSP25774 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSSP25774 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSSP25774 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSSP25774 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSSP25774 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSSP25774 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSSP25774 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSSP25774 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSSP25774 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSSP25774 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSSP25774 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSSP25774 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSSP25774 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSSP25774 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSSP25774 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSSP25774 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSSP25774 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSSP25774 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSSP25774 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms