Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRDP23468 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRDP23468 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRDP23468 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRDP23468 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRDP23468 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRDP23468 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRDP23468 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRDP23468 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRDP23468 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRDP23468 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRDP23468 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRDP23468 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRDP23468 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRDP23468 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRDP23468 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRDP23468 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRDP23468 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPRDP23468 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPRDP23468 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPRDP23468 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPRDP23468 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPRDP23468 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPRDP23468 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPRDP23468 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPRDP23468 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPRDP23468 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPRDP23468 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPRDP23468 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRDP23468 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
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