Protein–RNA interactions for Protein: P20941

PDC, Phosducin, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCP20941 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCP20941 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDCP20941 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDCP20941 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDCP20941 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDCP20941 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDCP20941 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDCP20941 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDCP20941 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDCP20941 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDCP20941 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDCP20941 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PDCP20941 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDCP20941 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDCP20941 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDCP20941 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDCP20941 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDCP20941 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDCP20941 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDCP20941 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PDCP20941 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDCP20941 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDCP20941 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDCP20941 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDCP20941 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDCP20941 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDCP20941 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDCP20941 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDCP20941 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDCP20941 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDCP20941 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDCP20941 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDCP20941 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDCP20941 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PDCP20941 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDCP20941 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDCP20941 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDCP20941 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDCP20941 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDCP20941 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDCP20941 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDCP20941 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDCP20941 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDCP20941 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDCP20941 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDCP20941 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDCP20941 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDCP20941 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDCP20941 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDCP20941 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDCP20941 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDCP20941 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDCP20941 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDCP20941 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDCP20941 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDCP20941 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDCP20941 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDCP20941 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDCP20941 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PDCP20941 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PDCP20941 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDCP20941 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDCP20941 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDCP20941 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDCP20941 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDCP20941 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDCP20941 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDCP20941 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDCP20941 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDCP20941 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDCP20941 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDCP20941 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDCP20941 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDCP20941 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDCP20941 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDCP20941 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDCP20941 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDCP20941 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDCP20941 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PDCP20941 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDCP20941 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDCP20941 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDCP20941 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDCP20941 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDCP20941 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDCP20941 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDCP20941 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDCP20941 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDCP20941 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDCP20941 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDCP20941 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDCP20941 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDCP20941 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDCP20941 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDCP20941 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDCP20941 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDCP20941 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDCP20941 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDCP20941 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDCP20941 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms