Protein–RNA interactions for Protein: P15692

VEGFA, Vascular endothelial growth factor A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFAP15692 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VEGFAP15692 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VEGFAP15692 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VEGFAP15692 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VEGFAP15692 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VEGFAP15692 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VEGFAP15692 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VEGFAP15692 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VEGFAP15692 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VEGFAP15692 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VEGFAP15692 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
VEGFAP15692 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VEGFAP15692 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VEGFAP15692 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VEGFAP15692 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VEGFAP15692 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VEGFAP15692 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VEGFAP15692 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VEGFAP15692 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VEGFAP15692 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VEGFAP15692 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VEGFAP15692 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VEGFAP15692 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VEGFAP15692 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VEGFAP15692 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VEGFAP15692 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VEGFAP15692 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VEGFAP15692 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
VEGFAP15692 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VEGFAP15692 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VEGFAP15692 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
VEGFAP15692 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VEGFAP15692 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VEGFAP15692 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
VEGFAP15692 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VEGFAP15692 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
VEGFAP15692 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
VEGFAP15692 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
VEGFAP15692 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VEGFAP15692 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VEGFAP15692 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VEGFAP15692 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VEGFAP15692 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VEGFAP15692 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VEGFAP15692 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VEGFAP15692 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VEGFAP15692 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
VEGFAP15692 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VEGFAP15692 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VEGFAP15692 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VEGFAP15692 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VEGFAP15692 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VEGFAP15692 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VEGFAP15692 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VEGFAP15692 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VEGFAP15692 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VEGFAP15692 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
VEGFAP15692 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VEGFAP15692 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VEGFAP15692 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VEGFAP15692 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VEGFAP15692 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VEGFAP15692 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VEGFAP15692 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VEGFAP15692 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VEGFAP15692 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VEGFAP15692 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VEGFAP15692 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VEGFAP15692 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VEGFAP15692 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VEGFAP15692 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VEGFAP15692 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VEGFAP15692 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VEGFAP15692 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VEGFAP15692 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
VEGFAP15692 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
VEGFAP15692 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VEGFAP15692 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VEGFAP15692 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VEGFAP15692 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
VEGFAP15692 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
VEGFAP15692 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VEGFAP15692 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VEGFAP15692 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VEGFAP15692 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VEGFAP15692 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VEGFAP15692 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VEGFAP15692 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VEGFAP15692 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
VEGFAP15692 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VEGFAP15692 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VEGFAP15692 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VEGFAP15692 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
VEGFAP15692 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VEGFAP15692 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VEGFAP15692 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VEGFAP15692 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VEGFAP15692 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VEGFAP15692 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VEGFAP15692 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms