Protein–RNA interactions for Protein: O15228

GNPAT, Dihydroxyacetone phosphate acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPATO15228 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GNPATO15228 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GNPATO15228 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GNPATO15228 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GNPATO15228 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GNPATO15228 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GNPATO15228 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GNPATO15228 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GNPATO15228 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GNPATO15228 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GNPATO15228 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GNPATO15228 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GNPATO15228 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GNPATO15228 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GNPATO15228 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GNPATO15228 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GNPATO15228 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GNPATO15228 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GNPATO15228 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GNPATO15228 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GNPATO15228 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GNPATO15228 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GNPATO15228 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GNPATO15228 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GNPATO15228 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GNPATO15228 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GNPATO15228 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GNPATO15228 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GNPATO15228 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GNPATO15228 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GNPATO15228 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GNPATO15228 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GNPATO15228 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GNPATO15228 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GNPATO15228 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GNPATO15228 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GNPATO15228 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GNPATO15228 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GNPATO15228 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GNPATO15228 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GNPATO15228 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GNPATO15228 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GNPATO15228 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GNPATO15228 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GNPATO15228 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GNPATO15228 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GNPATO15228 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GNPATO15228 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GNPATO15228 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GNPATO15228 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GNPATO15228 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GNPATO15228 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GNPATO15228 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GNPATO15228 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GNPATO15228 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GNPATO15228 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GNPATO15228 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GNPATO15228 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GNPATO15228 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GNPATO15228 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GNPATO15228 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GNPATO15228 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GNPATO15228 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GNPATO15228 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GNPATO15228 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GNPATO15228 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GNPATO15228 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GNPATO15228 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GNPATO15228 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GNPATO15228 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GNPATO15228 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GNPATO15228 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GNPATO15228 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GNPATO15228 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GNPATO15228 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GNPATO15228 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GNPATO15228 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GNPATO15228 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GNPATO15228 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GNPATO15228 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GNPATO15228 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GNPATO15228 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GNPATO15228 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GNPATO15228 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GNPATO15228 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GNPATO15228 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GNPATO15228 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GNPATO15228 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GNPATO15228 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GNPATO15228 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GNPATO15228 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GNPATO15228 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GNPATO15228 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GNPATO15228 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GNPATO15228 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GNPATO15228 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GNPATO15228 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GNPATO15228 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GNPATO15228 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GNPATO15228 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms