Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SYNMO15061 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SYNMO15061 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SYNMO15061 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SYNMO15061 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SYNMO15061 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SYNMO15061 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SYNMO15061 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SYNMO15061 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SYNMO15061 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SYNMO15061 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SYNMO15061 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SYNMO15061 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
SYNMO15061 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SYNMO15061 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SYNMO15061 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SYNMO15061 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SYNMO15061 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SYNMO15061 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
SYNMO15061 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SYNMO15061 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SYNMO15061 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SYNMO15061 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
SYNMO15061 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SYNMO15061 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SYNMO15061 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SYNMO15061 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
SYNMO15061 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SYNMO15061 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SYNMO15061 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SYNMO15061 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SYNMO15061 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SYNMO15061 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SYNMO15061 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SYNMO15061 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SYNMO15061 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
SYNMO15061 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
SYNMO15061 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SYNMO15061 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SYNMO15061 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SYNMO15061 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SYNMO15061 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SYNMO15061 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SYNMO15061 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SYNMO15061 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SYNMO15061 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SYNMO15061 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SYNMO15061 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SYNMO15061 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SYNMO15061 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SYNMO15061 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SYNMO15061 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SYNMO15061 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SYNMO15061 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SYNMO15061 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SYNMO15061 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SYNMO15061 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SYNMO15061 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SYNMO15061 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SYNMO15061 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SYNMO15061 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SYNMO15061 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SYNMO15061 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SYNMO15061 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SYNMO15061 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SYNMO15061 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SYNMO15061 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SYNMO15061 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SYNMO15061 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SYNMO15061 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SYNMO15061 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SYNMO15061 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SYNMO15061 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SYNMO15061 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SYNMO15061 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
SYNMO15061 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SYNMO15061 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SYNMO15061 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SYNMO15061 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SYNMO15061 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SYNMO15061 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SYNMO15061 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SYNMO15061 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SYNMO15061 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SYNMO15061 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SYNMO15061 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SYNMO15061 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SYNMO15061 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SYNMO15061 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SYNMO15061 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SYNMO15061 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SYNMO15061 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SYNMO15061 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SYNMO15061 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SYNMO15061 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SYNMO15061 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SYNMO15061 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SYNMO15061 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SYNMO15061 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SYNMO15061 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms