Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 DCUN1D1-204ENST00000469954 970 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 AC109327.1-201ENST00000471666 403 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 AC005726.1-201ENST00000494679 427 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 AC002460.1-201ENST00000504394 370 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 AC024589.1-201ENST00000512207 263 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 AC084880.2-201ENST00000536009 501 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
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USP18Q9UMW8 AL157786.1-204ENST00000594870 506 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 VN1R85P-201ENST00000601587 426 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 AC005191.1-201ENST00000603950 358 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 PLCE1-AS2-213ENST00000620469 432 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 AL356321.1-201ENST00000621360 228 ntBASIC5□□□□□ -1.61
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USP18Q9UMW8 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 LDHA-225ENST00000625635 141 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 ASB14-202ENST00000487349 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 LIX1-201ENST00000274382 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 ZNF382-204ENST00000439428 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 ERGIC2-201ENST00000360150 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
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USP18Q9UMW8 STAG2-203ENST00000371145 4393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 KIF3A-203ENST00000403231 2181 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 OR5A1-202ENST00000641045 8612 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 MYB-226ENST00000528774 2277 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 DHX40P1-201ENST00000588725 1412 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 ZNF733P-201ENST00000331425 1506 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 SLC30A7-201ENST00000357650 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
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USP18Q9UMW8 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
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USP18Q9UMW8 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
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USP18Q9UMW8 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 PPEF1-202ENST00000361511 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 AL122126.1-201ENST00000546905 1318 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 WDR7-201ENST00000254442 14083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 AC010928.1-201ENST00000592477 1447 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 DAZ1-205ENST00000540248 3268 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 RNA5SP447-201ENST00000363749 119 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
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