Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 RPL36AP36-201ENST00000418616 301 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 GCG-202ENST00000418842 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 LINC00382-201ENST00000427918 890 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 AF212831.1-201ENST00000430064 377 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 AL158209.1-201ENST00000433460 439 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 AL035246.1-201ENST00000433554 1255 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 AL023693.1-201ENST00000434255 216 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 REG1CP-203ENST00000434852 460 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 LINC00972-202ENST00000438065 788 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 AL356535.1-201ENST00000440335 398 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 AL589935.1-212ENST00000450998 525 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 ETV5-AS1-201ENST00000453370 560 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 HMGN2P7-201ENST00000456186 273 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 PNPLA4P1-201ENST00000458328 305 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 AC004069.2-201ENST00000505438 1114 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 AC008243.1-202ENST00000506527 481 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 AC096571.1-202ENST00000506634 735 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 AC109458.1-201ENST00000508858 316 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 RAC1P2-201ENST00000511164 579 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 AC011405.1-201ENST00000514207 248 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 AC093535.1-201ENST00000515808 747 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 RN7SKP244-201ENST00000516513 307 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 SCARNA14-201ENST00000516903 136 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 AC091163.3-201ENST00000518269 1144 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 LINC02365-202ENST00000520280 607 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 AC087672.2-201ENST00000522498 429 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 AP001189.2-201ENST00000527320 189 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 AL121766.1-201ENST00000547436 487 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 TRAV15-201ENST00000556680 249 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 MMP2-AS1-202ENST00000569037 553 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 AC069431.2-201ENST00000604149 1099 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 AC069545.1-201ENST00000605671 358 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 AL354696.2-202ENST00000620300 613 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 AC009269.6-201ENST00000621778 588 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 AC091905.1-201ENST00000624400 311 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 OR1S1-201ENST00000624470 978 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 ZNF663P-202ENST00000641770 1131 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 KYNU-202ENST00000375773 1772 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 TAF7L-201ENST00000324762 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 UACA-202ENST00000379983 4859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 ZNF92-204ENST00000450302 2957 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 CNOT10-206ENST00000454516 2760 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 AC084357.3-201ENST00000541353 2751 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 WDR72-201ENST00000360509 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 TRAJ16-201ENST00000390521 60 ntAPPRIS P1 BASIC3.49□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 SLC9B1P2-201ENST00000398120 1184 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 UBE2Q2P5Y-201ENST00000413867 207 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 PTP4A1P5-201ENST00000420305 455 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 AL159169.1-201ENST00000421119 127 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 RPL7P44-201ENST00000424827 742 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 AL590302.1-201ENST00000431017 359 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 UBE2Q2P4Y-201ENST00000433767 207 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 RRM2P4-201ENST00000441721 562 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC3.49□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 AL353613.1-201ENST00000443163 530 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 AL353743.2-203ENST00000443630 492 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 AL358794.1-201ENST00000445689 381 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 AC073486.1-201ENST00000453278 531 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 LINC00377-201ENST00000456588 657 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 MTCYBP16-201ENST00000509187 1129 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 RNU6-1261P-201ENST00000517194 104 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 LINC00534-201ENST00000517400 793 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 AC013437.1-201ENST00000549878 414 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 AC107016.1-201ENST00000550463 337 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 NDUFB1-204ENST00000555441 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 AC114546.1-201ENST00000560140 473 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 AC006960.3-201ENST00000561845 705 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 AL109618.2-201ENST00000605527 211 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 SNORA62.6-201ENST00000606322 83 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 AC103710.3-201ENST00000608157 948 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 LINC00649-214ENST00000609132 668 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 AP001521.1-201ENST00000609150 300 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 AL133445.2-201ENST00000611191 527 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 AC023158.2-201ENST00000614876 543 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 AC231759.1-201ENST00000616455 597 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 AL161637.1-201ENST00000622380 412 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
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