Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 TRIQK-209ENST00000519969 555 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SAMD8Q96LT4 C8orf22-204ENST00000522267 739 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SAMD8Q96LT4 AP000753.2-201ENST00000540307 423 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SAMD8Q96LT4 PRB1-204ENST00000546254 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SAMD8Q96LT4 LINC01491-202ENST00000558792 439 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SAMD8Q96LT4 AL034351.1-201ENST00000605288 668 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SAMD8Q96LT4 U7.8-201ENST00000619968 63 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SAMD8Q96LT4 AC073530.2-201ENST00000623987 261 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SAMD8Q96LT4 AP000720.1-201ENST00000625091 483 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SAMD8Q96LT4 SATB1-AS1-266ENST00000630271 813 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SAMD8Q96LT4 AC244205.2-202ENST00000635781 342 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SAMD8Q96LT4 CR381670.1-201ENST00000624291 1693 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SAMD8Q96LT4 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SAMD8Q96LT4 FAP-214ENST00000627638 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SAMD8Q96LT4 RNU6-657P-201ENST00000383904 107 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SAMD8Q96LT4 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SAMD8Q96LT4 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SAMD8Q96LT4 SNORD3H-201ENST00000384486 214 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SAMD8Q96LT4 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SAMD8Q96LT4 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SAMD8Q96LT4 Y_RNA.578-201ENST00000390903 88 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SAMD8Q96LT4 MTCO1P56-201ENST00000401674 224 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SAMD8Q96LT4 CYCSP45-201ENST00000402289 315 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SAMD8Q96LT4 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SAMD8Q96LT4 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SAMD8Q96LT4 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SAMD8Q96LT4 OR1AA1P-201ENST00000419597 916 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SAMD8Q96LT4 TCEA1P2-201ENST00000420496 906 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SAMD8Q96LT4 AL138760.1-201ENST00000423283 435 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SAMD8Q96LT4 USP9YP31-201ENST00000431405 881 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SAMD8Q96LT4 TRBV26OR9-2-201ENST00000432077 293 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SAMD8Q96LT4 SPINK8-201ENST00000434006 444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SAMD8Q96LT4 SEPT7P5-201ENST00000434048 306 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SAMD8Q96LT4 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SAMD8Q96LT4 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SAMD8Q96LT4 SKP1P1-201ENST00000438081 489 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SAMD8Q96LT4 HSFY6P-201ENST00000445573 403 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SAMD8Q96LT4 CASP12-207ENST00000447913 819 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
SAMD8Q96LT4 SLC31A1P1-201ENST00000451221 567 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SAMD8Q96LT4 RPL6P9-201ENST00000466502 859 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SAMD8Q96LT4 FPGT-203ENST00000467578 601 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SAMD8Q96LT4 RPS27AP1-201ENST00000475545 471 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SAMD8Q96LT4 AC096751.1-202ENST00000502691 1067 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SAMD8Q96LT4 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SAMD8Q96LT4 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SAMD8Q96LT4 AC010460.2-201ENST00000509054 677 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SAMD8Q96LT4 AC092440.1-201ENST00000512563 571 ntTSL 4 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SAMD8Q96LT4 LINC02014-201ENST00000514010 713 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SAMD8Q96LT4 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SAMD8Q96LT4 RNA5SP315-201ENST00000516340 116 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SAMD8Q96LT4 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SAMD8Q96LT4 AP003386.1-201ENST00000526509 504 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SAMD8Q96LT4 CARD18-201ENST00000526823 627 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
SAMD8Q96LT4 AL356215.1-201ENST00000528366 1102 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SAMD8Q96LT4 AL139174.1-201ENST00000531489 886 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SAMD8Q96LT4 AP000619.3-201ENST00000535634 1127 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SAMD8Q96LT4 LRRC37A5P-202ENST00000536054 1095 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
SAMD8Q96LT4 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SAMD8Q96LT4 AC079598.1-201ENST00000548691 554 ntTSL 4 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SAMD8Q96LT4 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SAMD8Q96LT4 AP001180.2-201ENST00000579413 422 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SAMD8Q96LT4 AP005264.4-201ENST00000592203 422 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SAMD8Q96LT4 AL137849.1-201ENST00000604767 169 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SAMD8Q96LT4 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SAMD8Q96LT4 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SAMD8Q96LT4 AL158835.3-201ENST00000625908 565 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SAMD8Q96LT4 FLG-AS1-207ENST00000628475 497 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SAMD8Q96LT4 CASC15-208ENST00000636388 1174 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SAMD8Q96LT4 LINC00690-201ENST00000429949 1365 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
SAMD8Q96LT4 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SAMD8Q96LT4 ZBTB37-201ENST00000367701 19128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
SAMD8Q96LT4 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
SAMD8Q96LT4 TTC41P-203ENST00000548527 1475 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SAMD8Q96LT4 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.85
SAMD8Q96LT4 WNK3-205ENST00000620763 5400 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.85
SAMD8Q96LT4 UGT2B10-201ENST00000265403 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.85
SAMD8Q96LT4 KLRC1-202ENST00000359151 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
SAMD8Q96LT4 RAD17-202ENST00000305138 3164 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
SAMD8Q96LT4 CNOT4-202ENST00000356162 2594 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SAMD8Q96LT4 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
SAMD8Q96LT4 OR8G1-201ENST00000341493 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SAMD8Q96LT4 KLRC3-201ENST00000381903 798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
SAMD8Q96LT4 MIR199A2-201ENST00000385289 110 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SAMD8Q96LT4 CLK1-203ENST00000409769 1192 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SAMD8Q96LT4 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SAMD8Q96LT4 MTND4P3-201ENST00000417829 541 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SAMD8Q96LT4 Z97055.1-201ENST00000419730 712 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SAMD8Q96LT4 AL353801.1-201ENST00000425541 425 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SAMD8Q96LT4 IGKV1OR9-2-201ENST00000431378 277 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SAMD8Q96LT4 C4orf26-202ENST00000435974 560 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SAMD8Q96LT4 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SAMD8Q96LT4 VN1R10P-201ENST00000447106 875 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SAMD8Q96LT4 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SAMD8Q96LT4 AL445669.2-201ENST00000454425 421 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SAMD8Q96LT4 MTCO3P16-201ENST00000454456 754 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SAMD8Q96LT4 AC092754.2-201ENST00000463506 460 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SAMD8Q96LT4 AC092757.1-201ENST00000467293 467 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SAMD8Q96LT4 RPS3AP6-201ENST00000484430 795 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SAMD8Q96LT4 LINC00971-203ENST00000491849 452 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SAMD8Q96LT4 AC108941.1-201ENST00000502853 530 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.3 ms