Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 SLC9B1P2-201ENST00000398120 1184 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Q1T7F1 DEFB133-201ENST00000398721 186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
Q1T7F1 YWHAZP6-201ENST00000399764 738 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Q1T7F1 GTF3AP1-201ENST00000416942 1004 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Q1T7F1 AC002454.1-204ENST00000419668 527 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
Q1T7F1 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Q1T7F1 AL353678.1-201ENST00000422735 741 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Q1T7F1 AL158840.1-202ENST00000425754 694 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
Q1T7F1 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Q1T7F1 FSIP2-AS1-201ENST00000429929 440 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
Q1T7F1 VTCN1-204ENST00000430871 569 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
Q1T7F1 Z99758.1-201ENST00000432081 368 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
Q1T7F1 ZFAND6P1-201ENST00000434138 605 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Q1T7F1 AL390119.1-201ENST00000440329 312 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Q1T7F1 RPS10P14-201ENST00000440748 502 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Q1T7F1 AC234781.1-201ENST00000444722 459 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
Q1T7F1 ST13P20-201ENST00000447996 1065 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Q1T7F1 AL359073.1-201ENST00000448036 403 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Q1T7F1 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Q1T7F1 ETV5-AS1-201ENST00000453370 560 ntTSL 4 BASIC1.72□□□□□ -2.13
Q1T7F1 AC017101.1-201ENST00000453665 571 ntTSL 4 BASIC1.72□□□□□ -2.13
Q1T7F1 RPL31P11-202ENST00000454082 372 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Q1T7F1 AL359385.1-201ENST00000456509 365 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Q1T7F1 RPL38P1-201ENST00000460914 211 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Q1T7F1 C2orf74-204ENST00000464909 726 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
Q1T7F1 MED27-204ENST00000474263 762 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
Q1T7F1 ACTR3P3-201ENST00000480448 893 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Q1T7F1 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Q1T7F1 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Q1T7F1 KRTAP5-14P-201ENST00000502328 121 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Q1T7F1 AC011352.3-201ENST00000505162 593 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Q1T7F1 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
Q1T7F1 AC025768.1-201ENST00000510057 267 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Q1T7F1 AC131956.2-201ENST00000510922 512 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
Q1T7F1 AC093248.1-201ENST00000513197 417 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
Q1T7F1 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
Q1T7F1 OR5H7P-201ENST00000514084 930 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Q1T7F1 HAPLN1-206ENST00000514416 1145 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
Q1T7F1 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Q1T7F1 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Q1T7F1 AC138701.1-201ENST00000524329 714 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Q1T7F1 ZNF705CP-201ENST00000530515 889 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Q1T7F1 LINC02384-206ENST00000541707 904 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
Q1T7F1 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
Q1T7F1 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
Q1T7F1 AP000593.3-201ENST00000546065 578 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
Q1T7F1 AC025263.2-201ENST00000550437 548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
Q1T7F1 EEF1B2P4-201ENST00000551398 348 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Q1T7F1 LINC02410-201ENST00000553095 393 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
Q1T7F1 LINC02274-201ENST00000555539 1174 ntTSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
Q1T7F1 AL049835.1-201ENST00000555850 514 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
Q1T7F1 LINC01146-208ENST00000557355 548 ntTSL 4 BASIC1.72□□□□□ -2.13
Q1T7F1 AL359238.1-201ENST00000557770 744 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
Q1T7F1 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Q1T7F1 AP005205.1-201ENST00000563503 508 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Q1T7F1 AC103876.1-201ENST00000568634 418 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
Q1T7F1 MMP2-AS1-202ENST00000569037 553 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
Q1T7F1 AC092121.1-201ENST00000569452 202 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Q1T7F1 MTATP6P25-201ENST00000574491 261 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Q1T7F1 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Q1T7F1 LINC01900-202ENST00000584898 603 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
Q1T7F1 GALP-203ENST00000590002 150 ntTSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
Q1T7F1 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
Q1T7F1 AC040174.2-201ENST00000602701 465 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Q1T7F1 AC055876.5-201ENST00000605667 259 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Q1T7F1 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
Q1T7F1 AC012409.3-201ENST00000611343 981 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Q1T7F1 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Q1T7F1 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Q1T7F1 AL354696.2-202ENST00000620300 613 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
Q1T7F1 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
Q1T7F1 AC132825.7-201ENST00000638744 335 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Q1T7F1 MFSD8-245ENST00000641743 948 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Q1T7F1 ADAM18-206ENST00000520772 1429 ntTSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
Q1T7F1 TANK-205ENST00000405852 2155 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
Q1T7F1 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
Q1T7F1 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
Q1T7F1 ATXN3-207ENST00000503767 1315 ntTSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
Q1T7F1 AL645937.1-201ENST00000641739 1652 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Q1T7F1 AC008505.1-201ENST00000637582 2025 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
Q1T7F1 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC1.71□□□□□ -2.14
Q1T7F1 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC1.71□□□□□ -2.14
Q1T7F1 CCDC169-201ENST00000239859 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
Q1T7F1 AL080312.1-201ENST00000256654 824 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Q1T7F1 OR5P1P-201ENST00000299512 925 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Q1T7F1 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Q1T7F1 MLLT3-201ENST00000380321 708 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
Q1T7F1 RNU1-106P-201ENST00000384382 164 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Q1T7F1 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Q1T7F1 MIR16-1-201ENST00000385271 89 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Q1T7F1 RNU11-4P-201ENST00000391149 133 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Q1T7F1 AL121978.1-201ENST00000402778 359 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Q1T7F1 GCNT1P4-201ENST00000404096 329 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Q1T7F1 RN7SKP229-201ENST00000410465 302 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Q1T7F1 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Q1T7F1 BMS1P17-201ENST00000413661 723 ntTSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
Q1T7F1 AL445183.3-201ENST00000414168 502 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Q1T7F1 MORF4L1P6-201ENST00000418771 268 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Q1T7F1 AL390962.1-201ENST00000421507 526 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
Q1T7F1 AC004415.1-201ENST00000422697 449 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.5 ms