Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 AP002371.1-201ENST00000463604 433 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRKQ15262 RN7SKP34-201ENST00000516142 244 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRKQ15262 AP002993.1-201ENST00000538624 210 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRKQ15262 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRKQ15262 LINC00640-203ENST00000556479 576 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRKQ15262 AP003072.5-201ENST00000623872 773 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRKQ15262 AL928596.1-201ENST00000636738 632 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRKQ15262 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRKQ15262 SCN3A-209ENST00000639244 8854 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRKQ15262 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRKQ15262 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRKQ15262 IQCM-206ENST00000636793 1900 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRKQ15262 AC107021.2-201ENST00000567714 2095 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPRKQ15262 OR52B1P-201ENST00000316506 909 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPRKQ15262 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPRKQ15262 RNU1-87P-201ENST00000363727 170 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPRKQ15262 PTPRC-202ENST00000367364 1017 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPRKQ15262 RNU6-1320P-201ENST00000390838 107 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPRKQ15262 RNU6-1269P-201ENST00000391139 107 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
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PTPRKQ15262 AC024619.1-202ENST00000426489 495 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPRKQ15262 AL138787.1-202ENST00000437804 898 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPRKQ15262 AC000111.1-201ENST00000441019 221 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPRKQ15262 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPRKQ15262 RNU6-599P-201ENST00000459383 107 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPRKQ15262 RNU6-1193P-201ENST00000459461 107 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPRKQ15262 AC107015.1-201ENST00000466902 747 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
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PTPRKQ15262 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
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PTPRKQ15262 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPRKQ15262 AL356274.1-201ENST00000617064 410 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPRKQ15262 RNU6-368P-201ENST00000620928 107 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
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PTPRKQ15262 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPRKQ15262 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPRKQ15262 OR11H5P-202ENST00000641612 1325 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPRKQ15262 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRKQ15262 OR6C74-201ENST00000343870 1105 ntAPPRIS P1 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRKQ15262 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRKQ15262 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRKQ15262 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRKQ15262 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRKQ15262 AL590290.1-201ENST00000405336 380 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
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PTPRKQ15262 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
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PTPRKQ15262 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRKQ15262 AL450263.2-201ENST00000439400 589 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
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PTPRKQ15262 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
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PTPRKQ15262 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRKQ15262 AC090409.2-202ENST00000585706 604 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRKQ15262 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRKQ15262 AL159169.2-201ENST00000610061 1269 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRKQ15262 ZNF678-202ENST00000397097 8212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
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PTPRKQ15262 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
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PTPRKQ15262 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
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PTPRKQ15262 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPRKQ15262 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPRKQ15262 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPRKQ15262 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPRKQ15262 MEI4-201ENST00000602452 4800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPRKQ15262 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPRKQ15262 ANKRD28-215ENST00000624145 6383 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPRKQ15262 OR5B12-202ENST00000641921 1807 ntAPPRIS P1 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPRKQ15262 SUMO1-205ENST00000409205 534 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPRKQ15262 LINC01752-201ENST00000417299 438 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPRKQ15262 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPRKQ15262 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPRKQ15262 AC093663.2-201ENST00000484625 313 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPRKQ15262 RPS27AP18-201ENST00000515536 459 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPRKQ15262 AP003102.1-201ENST00000525638 661 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPRKQ15262 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPRKQ15262 AL161804.1-201ENST00000555600 708 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPRKQ15262 AL121839.1-201ENST00000556233 1185 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
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