Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 DPPA3-201ENST00000345088 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 FRG1CP-201ENST00000358464 769 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 RN7SKP159-201ENST00000410657 292 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 FAM230B-202ENST00000415704 396 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 LIPT1P1-201ENST00000415870 1186 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 AC127526.1-201ENST00000417526 366 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 RPS6P14-201ENST00000425165 719 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 AL096803.2-201ENST00000450032 677 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 SUN3-208ENST00000453192 801 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 NAP1L1P3-201ENST00000462291 880 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 PDCD10-206ENST00000470131 1026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 AC010301.1-201ENST00000473936 355 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 AC021180.1-201ENST00000508581 558 ntTSL 4 BASIC3.4□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 AC119751.1-201ENST00000513357 765 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 RNU6-579P-201ENST00000516879 102 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 RANP9-201ENST00000519957 271 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 AC068875.1-201ENST00000561054 463 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 AC087481.2-201ENST00000565492 330 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 AC100781.1-203ENST00000598549 399 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 AC010591.1-201ENST00000603941 649 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 AL365400.2-201ENST00000605604 902 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 AL121772.2-201ENST00000614331 297 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 AP006248.3-201ENST00000623580 594 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 PGGT1B-203ENST00000419445 9545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 AC068647.1-201ENST00000489539 2265 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC3.4□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 TCEAL7-202ENST00000372666 852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 TXN-201ENST00000374515 635 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 RNU6-481P-201ENST00000384194 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 SNORD65C-201ENST00000390962 71 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 RN7SKP53-201ENST00000411337 315 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 REV3L-IT1-201ENST00000411895 382 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 FAM204CP-201ENST00000424489 642 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 AL035246.1-201ENST00000433554 1255 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
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DDX39BQ13838 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 RPL17P49-201ENST00000443728 411 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
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DDX39BQ13838 AL353718.1-201ENST00000451028 517 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 PDCD10-207ENST00000471885 764 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 FCF1P3-201ENST00000496394 590 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 OTUD4-208ENST00000509620 864 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 RN7SKP18-201ENST00000516005 275 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 NAT2-202ENST00000520116 716 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 AC006065.3-201ENST00000541769 419 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
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DDX39BQ13838 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 AC135050.5-201ENST00000576336 543 ntTSL 4 BASIC3.39□□□□□ -1.87
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DDX39BQ13838 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 ABCC9-206ENST00000621589 450 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 HPVC1-201ENST00000629899 1198 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 SATB1-AS1-269ENST00000630766 591 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 CRNDE-213ENST00000635991 546 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 HSFY1P1-202ENST00000425038 1381 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 CNBD1-202ENST00000518476 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 PTER-201ENST00000298942 3448 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 TMSB4XP8-201ENST00000402089 135 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 AC009505.1-201ENST00000413151 424 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 TMSB4XP6-201ENST00000415187 135 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 AC068533.1-201ENST00000418542 415 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 GRM7-AS1-201ENST00000420230 430 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 TMSB4XP1-201ENST00000424567 135 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 BBS9-205ENST00000425508 1252 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 AC017002.2-201ENST00000426124 792 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
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