Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 C6orf10-207ENST00000533191 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 DDX4-202ENST00000354991 2324 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 SLC1A3-215ENST00000612708 3832 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 OR56A1-202ENST00000641423 6096 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 RMST-209ENST00000639542 3269 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 AC022164.1-201ENST00000568767 2673 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 PPP2R2A-201ENST00000315985 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 NUP35P2-201ENST00000416748 943 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 AC009965.2-201ENST00000425328 970 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 TRAPPC2P5-201ENST00000426293 308 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 RWDD4P2-201ENST00000426392 563 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 AL136140.1-201ENST00000436113 473 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 AL162419.1-201ENST00000440674 873 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 IMMP2L-205ENST00000450877 761 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 RPS20P32-201ENST00000456044 356 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 RPL7P15-201ENST00000461190 712 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 AC114967.1-201ENST00000504890 259 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 AC018797.3-201ENST00000513388 1241 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 AC011363.1-201ENST00000524198 458 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 AP003718.1-201ENST00000529884 583 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 AL354920.1-202ENST00000531661 1017 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 CBX3P5-201ENST00000552017 521 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 AC099489.2-201ENST00000574976 260 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 AC090371.2-205ENST00000580366 490 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 MIR3138-201ENST00000585238 82 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 TTN-AS1-228ENST00000589234 751 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 AC008814.1-201ENST00000603797 406 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 AC010680.3-201ENST00000604215 520 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 AC006065.6-201ENST00000625201 545 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 LRRN3-204ENST00000451085 3725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 ZNF85-201ENST00000300540 1531 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 CUL3-216ENST00000617432 1426 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 MYB-239ENST00000534121 2238 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 HYKK-206ENST00000569878 4097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 MAP3K19-204ENST00000392915 5030 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 AC008060.2-201ENST00000415333 468 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 OR2B7P-201ENST00000429302 934 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 AL353748.1-201ENST00000440753 474 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 MED28P3-201ENST00000444288 531 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 NUTF2P3-201ENST00000448540 384 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 TCEA1P1-201ENST00000449716 880 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 AC104316.1-201ENST00000521258 625 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 AC008149.1-201ENST00000551844 525 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 LINC02186-201ENST00000575767 885 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 AC090403.1-205ENST00000580883 516 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 AC069061.3-201ENST00000582254 823 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 LINC01539-206ENST00000593282 678 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 AC138393.3-201ENST00000618397 573 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 AC068722.2-201ENST00000618734 544 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 CAB39L-206ENST00000410043 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 OR2A7-202ENST00000641841 2062 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 HHLA2-209ENST00000489514 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 ARHGAP5-210ENST00000556611 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 AASDH-210ENST00000602986 3480 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 STAMBPL1-202ENST00000371924 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 ENKUR-205ENST00000615958 3294 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 PPHLN1-208ENST00000449194 1583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
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