Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 CDKL5-205ENST00000623535 12533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 PHC3-214ENST00000494943 5030 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 DAZ1-205ENST00000540248 3268 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 GTDC1-207ENST00000409298 2209 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 OPRM1-215ENST00000520708 1519 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 ETV1-208ENST00000420159 6231 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 HECTD4-211ENST00000550722 15450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 SAMMSON-226ENST00000642089 1582 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 ARHGAP20-204ENST00000528829 5880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 RIOK3P1-201ENST00000418778 1528 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 RNU6-98P-201ENST00000384173 107 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 TRAV12-2-201ENST00000390437 445 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 RPS4XP9-201ENST00000405151 780 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 AL035079.1-201ENST00000405210 287 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 AC073521.1-201ENST00000418679 625 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 REREP1Y-201ENST00000422655 198 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 AL357833.2-201ENST00000426811 430 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 AL590999.1-204ENST00000430595 638 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 RPL7P29-201ENST00000437151 728 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 REREP2Y-201ENST00000439103 200 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 MEMO1P3-201ENST00000459811 302 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 AC117513.1-201ENST00000462792 766 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 AC017015.1-201ENST00000477387 286 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 RPSAP51-201ENST00000497462 645 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 AC091180.4-201ENST00000511322 245 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 PTP4A1P6-201ENST00000531034 478 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 GABARAPL1-212ENST00000543602 653 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 AC040958.1-201ENST00000561102 201 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 AGBL1-AS1-203ENST00000566878 865 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 AC144836.1-201ENST00000575911 340 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 PINCR-201ENST00000440955 2228 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 RNF150-202ENST00000420921 3673 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 PROS2P-201ENST00000474651 1951 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 MPDZ-219ENST00000546205 6342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 LINC01249-201ENST00000412134 2663 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 DOPEY1-201ENST00000237163 7995 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 UGT2B17-201ENST00000317746 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 WEE2-201ENST00000397541 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 MTERF1-201ENST00000351870 1997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 MGP-201ENST00000228938 694 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 HNMT-201ENST00000280096 504 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 SNORA70.10-201ENST00000384515 134 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 AL034403.1-201ENST00000399414 885 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 RNA5SP345-201ENST00000410646 108 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 AC068483.1-201ENST00000413403 660 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 COX5BP7-201ENST00000414780 274 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 AC005517.2-201ENST00000424673 553 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 AC068058.1-201ENST00000435782 389 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 ZDHHC20P1-204ENST00000435787 423 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 AL445644.1-201ENST00000436524 751 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 AC017101.1-201ENST00000453665 571 ntTSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 AC091180.1-201ENST00000462104 372 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 AC135999.1-201ENST00000478962 479 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 LINC02005-201ENST00000498832 782 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 GYPA-203ENST00000503627 318 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 RNU6-150P-201ENST00000516237 95 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 RNU6-1004P-201ENST00000516584 111 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 AP006289.1-201ENST00000538089 277 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 AC009562.1-202ENST00000558755 565 ntTSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 LINC00347-205ENST00000597518 868 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 AC012603.1-201ENST00000606424 528 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 MIR6798-201ENST00000612887 67 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 AC234782.5-201ENST00000617723 324 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 DLEU1_2.1-201ENST00000617920 342 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 ITGA9-AS1-218ENST00000630762 751 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
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