Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 AC234781.2-201ENST00000426370 994 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 ATP5HP2-201ENST00000433885 485 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 AL354941.1-201ENST00000438600 464 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 AC096558.1-202ENST00000442794 561 ntTSL 4 BASIC4.09□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 AF127577.5-201ENST00000449746 446 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 AC010235.1-201ENST00000450613 547 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 PLCB1-IT1-202ENST00000451443 251 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 AC087879.1-201ENST00000474343 374 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 LINC01861-201ENST00000509568 537 ntTSL 4 BASIC4.09□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 AC108866.1-202ENST00000511064 573 ntTSL 4 BASIC4.09□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 AC104393.1-201ENST00000517495 255 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 IGLVIV-53-201ENST00000520107 367 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 AC100782.1-201ENST00000520778 590 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 AC026904.2-201ENST00000521359 537 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 TPT1-AS1-216ENST00000522845 403 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 GYPA-211ENST00000535709 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 AC063950.1-201ENST00000552036 308 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 AC008015.1-201ENST00000555505 465 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 MTCYBP28-201ENST00000566728 1132 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 AC005951.1-201ENST00000576706 485 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 AC005412.1-201ENST00000580812 1049 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 LINC02109-204ENST00000602801 563 ntTSL 4 BASIC4.09□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 AL022161.1-201ENST00000604390 213 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 AL592221.1-201ENST00000605266 382 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 AL589740.1-208ENST00000606913 812 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 SLC38A2-214ENST00000612232 1221 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 AL607023.1-201ENST00000620045 248 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 AC004943.3-201ENST00000624116 600 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 AC092184.1-201ENST00000625042 715 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 TTN-AS1-267ENST00000628826 662 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 PCDH11X-206ENST00000373097 9146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 PTGFR-203ENST00000370758 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 FGD4-211ENST00000531134 2924 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 GLIPR1-201ENST00000266659 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 SGO1P2-201ENST00000429458 1589 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 MTND5P28-201ENST00000438005 1594 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 LINS1-201ENST00000314742 4821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.76
GRIK2Q13002 FEZ2-201ENST00000305852 1782 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.76
GRIK2Q13002 ERCC6-202ENST00000374127 1782 ntBASIC4.09□□□□□ -1.76
GRIK2Q13002 UGT8-202ENST00000394511 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
GRIK2Q13002 AL592437.2-201ENST00000421655 2434 ntBASIC4.09□□□□□ -1.76
GRIK2Q13002 UTRN-204ENST00000367545 12339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
GRIK2Q13002 FKTN-201ENST00000223528 7364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
GRIK2Q13002 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
GRIK2Q13002 CD80-201ENST00000264246 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
GRIK2Q13002 OR4F6-201ENST00000328882 1238 ntAPPRIS P1 BASIC4.08□□□□□ -1.76
GRIK2Q13002 C1orf105-201ENST00000367725 888 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
GRIK2Q13002 DPRX-201ENST00000376650 648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
GRIK2Q13002 MBD5-202ENST00000407073 9512 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
GRIK2Q13002 AC073264.1-201ENST00000411508 416 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
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GRIK2Q13002 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
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GRIK2Q13002 NUP35P2-201ENST00000416748 943 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
GRIK2Q13002 RMDN2-207ENST00000417700 1426 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
GRIK2Q13002 MTND2P18-201ENST00000419962 1030 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
GRIK2Q13002 SDCBPP2-201ENST00000424643 885 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
GRIK2Q13002 LINC01674-201ENST00000427446 504 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
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GRIK2Q13002 MTND5P2-201ENST00000442927 1142 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
GRIK2Q13002 RPS26P56-201ENST00000444468 240 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
GRIK2Q13002 CHODL-AS1-201ENST00000447175 1117 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
GRIK2Q13002 VPS29-202ENST00000447578 996 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
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GRIK2Q13002 PAIP2-205ENST00000510080 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
GRIK2Q13002 MTCYBP37-201ENST00000510642 1133 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
GRIK2Q13002 MRPS33P3-201ENST00000513456 322 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
GRIK2Q13002 LINC02484-201ENST00000513843 546 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
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GRIK2Q13002 EED-206ENST00000527888 1422 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
GRIK2Q13002 IAPP-204ENST00000539393 409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
GRIK2Q13002 REXO2-218ENST00000544827 880 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
GRIK2Q13002 UTS2-201ENST00000054668 420 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
GRIK2Q13002 AC093025.1-201ENST00000547795 569 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
GRIK2Q13002 LINC02290-203ENST00000556662 577 ntTSL 4 BASIC4.08□□□□□ -1.76
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GRIK2Q13002 AC092364.1-201ENST00000598561 471 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
GRIK2Q13002 AP000526.1-201ENST00000603308 1388 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
GRIK2Q13002 AL358072.1-201ENST00000604156 575 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
GRIK2Q13002 AC116667.1-201ENST00000604855 2072 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
GRIK2Q13002 AC069200.1-201ENST00000609511 323 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
GRIK2Q13002 AL360219.1-201ENST00000610230 366 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
GRIK2Q13002 AL354798.1-201ENST00000622505 329 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
GRIK2Q13002 EFHC1-205ENST00000538167 5308 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
GRIK2Q13002 VEPH1-203ENST00000392833 3979 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
GRIK2Q13002 ZSCAN26-204ENST00000614088 2321 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
GRIK2Q13002 GPR171-201ENST00000309180 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
GRIK2Q13002 MYCBP2-211ENST00000544440 14664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
GRIK2Q13002 DOCK7-218ENST00000635123 6297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
GRIK2Q13002 PLCL1-203ENST00000437704 5979 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
GRIK2Q13002 KCNJ13-201ENST00000233826 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
GRIK2Q13002 OTUD6B-AS1-201ENST00000522817 4275 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
GRIK2Q13002 MSTN-201ENST00000260950 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
GRIK2Q13002 ACEA_U3.1-201ENST00000363057 217 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
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