Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
CENPFP49454 FBXO3-210ENST00000532057 918 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
CENPFP49454 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.96
CENPFP49454 ODAM-201ENST00000396094 1319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
CENPFP49454 CACNB4-257ENST00000637547 7658 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
CENPFP49454 YES1-203ENST00000577961 4554 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
CENPFP49454 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CENPFP49454 OR2AS1P-201ENST00000427827 319 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CENPFP49454 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CENPFP49454 AC093903.1-201ENST00000507220 405 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CENPFP49454 AL109741.3-201ENST00000561748 592 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CENPFP49454 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CENPFP49454 Z82195.1-201ENST00000604558 398 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CENPFP49454 PLCE1-AS2-213ENST00000620469 432 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CENPFP49454 AC090897.3-201ENST00000636973 1157 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CENPFP49454 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CENPFP49454 GYPA-212ENST00000616983 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CENPFP49454 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CENPFP49454 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CENPFP49454 AL121882.1-201ENST00000422893 417 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CENPFP49454 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CENPFP49454 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CENPFP49454 OR8D1-202ENST00000641015 8286 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CENPFP49454 OR8D1-203ENST00000641897 8285 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CENPFP49454 CTNNA3-203ENST00000433211 10675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
CENPFP49454 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CENPFP49454 SNORA70E-201ENST00000384492 135 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CENPFP49454 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CENPFP49454 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CENPFP49454 AP005433.1-201ENST00000582939 620 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CENPFP49454 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CENPFP49454 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CENPFP49454 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CENPFP49454 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
CENPFP49454 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CENPFP49454 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CENPFP49454 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CENPFP49454 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CENPFP49454 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CENPFP49454 AC138956.1-201ENST00000508187 504 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CENPFP49454 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CENPFP49454 PWRN1-206ENST00000565512 433 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CENPFP49454 AC008277.2-201ENST00000605196 797 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CENPFP49454 STK31-205ENST00000433467 3085 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CENPFP49454 TTC37-201ENST00000358746 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
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CENPFP49454 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CENPFP49454 AC068587.2-201ENST00000478386 781 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CENPFP49454 LINC02230-201ENST00000511174 301 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
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CENPFP49454 AC016493.1-201ENST00000586106 688 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
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CENPFP49454 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
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CENPFP49454 MTHFD2P4-201ENST00000515074 1025 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
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CENPFP49454 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CENPFP49454 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
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CENPFP49454 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CENPFP49454 AC103858.2-201ENST00000621471 543 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CENPFP49454 LINC02109-206ENST00000629527 854 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
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CENPFP49454 C9orf72-202ENST00000379997 1873 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CENPFP49454 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
CENPFP49454 NREP-207ENST00000450761 636 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CENPFP49454 AC112673.1-201ENST00000513168 575 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CENPFP49454 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CENPFP49454 AL135746.1-201ENST00000554205 547 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
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CENPFP49454 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
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CENPFP49454 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
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CENPFP49454 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CENPFP49454 AP001085.1-201ENST00000524441 639 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CENPFP49454 RPP40P2-201ENST00000603596 712 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CENPFP49454 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CENPFP49454 MTND5P28-201ENST00000438005 1594 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CENPFP49454 ATP13A3-203ENST00000439040 7720 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CENPFP49454 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
CENPFP49454 LINC02143-201ENST00000519929 520 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CENPFP49454 AL161896.1-201ENST00000597248 508 ntTSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CENPFP49454 IL23R-202ENST00000395227 1459 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CENPFP49454 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CENPFP49454 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CENPFP49454 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CENPFP49454 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CENPFP49454 OBSCN-214ENST00000636875 23907 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CENPFP49454 TAF9P1-201ENST00000445421 515 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CENPFP49454 TAF9P2-201ENST00000454958 515 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CENPFP49454 FABP5P12-201ENST00000515543 389 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CENPFP49454 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CENPFP49454 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
CENPFP49454 AC087565.3-202ENST00000642085 1603 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
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