Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 FOXP2-203ENST00000378237 2187 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
RTN1Q16799 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
RTN1Q16799 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
RTN1Q16799 LINC01153-201ENST00000429809 2864 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
RTN1Q16799 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
RTN1Q16799 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
RTN1Q16799 CACNB4-245ENST00000637284 2423 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
RTN1Q16799 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.41
RTN1Q16799 LGALSL-202ENST00000409537 3298 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
RTN1Q16799 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
RTN1Q16799 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
RTN1Q16799 RALGAPA1P1-201ENST00000443361 6232 ntBASIC6.21□□□□□ -1.41
RTN1Q16799 AP001267.1-201ENST00000531742 2074 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.41
RTN1Q16799 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 RN7SKP162-201ENST00000363605 345 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 AL161631.1-201ENST00000417933 486 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 RPL7AP49-201ENST00000429522 581 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 RPL7L1P9-201ENST00000431298 745 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 RPL34P6-201ENST00000432390 345 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 AC011225.1-201ENST00000457751 369 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 RPS4XP10-201ENST00000465034 731 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 ST13P14-201ENST00000474095 734 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 AP000797.2-201ENST00000475768 606 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 AC027613.1-201ENST00000508414 457 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 ATP5LP3-201ENST00000514223 304 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 BX510359.5-201ENST00000515651 304 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 LINC00535-202ENST00000517785 264 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 AC011363.1-201ENST00000524198 458 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 AC027026.1-201ENST00000532323 742 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 LDHC-203ENST00000535809 757 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 LINC02390-201ENST00000541404 560 ntTSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 AL355097.1-201ENST00000555889 539 ntTSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 MIR6862-1-201ENST00000613016 70 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 MIR6862-2-201ENST00000614755 70 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 CTSLP2-203ENST00000628708 493 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 C2orf83-206ENST00000642055 453 ntAPPRIS P3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 CRYZ-204ENST00000370872 1592 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 DAZ4-205ENST00000440066 1891 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 ZNF418-212ENST00000616958 2212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 C1orf140-202ENST00000439004 4340 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 ANO4-202ENST00000392979 3909 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 NRCAM-210ENST00000425651 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 ZNF382-201ENST00000292928 8329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 ARHGAP5-206ENST00000539826 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 ERVW-1-201ENST00000493463 2925 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 XPOTP1-201ENST00000443317 2398 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 TSHB-201ENST00000256592 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 MAX-203ENST00000341653 330 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 RNU1-19P-201ENST00000363306 165 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 AC092675.1-201ENST00000409490 561 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 RNU2-22P-201ENST00000411266 212 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 ARSD-AS1-201ENST00000414053 816 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 AP000936.3-201ENST00000438127 255 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 RPS11P7-201ENST00000442125 465 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 ITGA9-AS1-207ENST00000445429 532 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 AC090804.1-201ENST00000448870 490 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 SNAP25-AS1-205ENST00000453544 368 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 AC012181.1-201ENST00000479895 423 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 AC008592.2-201ENST00000506070 571 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 WWC2-AS1-201ENST00000511846 404 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 AC107391.1-201ENST00000514966 412 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 RNA5SP373-201ENST00000517271 95 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 AC040914.1-201ENST00000518674 318 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 PAFAH1B2-206ENST00000530272 850 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 AC090457.1-201ENST00000579775 211 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 OR6R2P-201ENST00000609216 300 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 MIR6729-201ENST00000618194 65 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 CYP4F35P-202ENST00000636121 390 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 AC074101.1-201ENST00000637861 241 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 GLYATL1-201ENST00000300079 2068 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.9 ms