Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FSCN1Q16658 PTS-202ENST00000524931 696 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FSCN1Q16658 ARL6IP1P1-201ENST00000545836 610 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FSCN1Q16658 AC024909.1-201ENST00000549278 599 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FSCN1Q16658 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FSCN1Q16658 AC090948.2-201ENST00000607363 564 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FSCN1Q16658 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FSCN1Q16658 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FSCN1Q16658 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FSCN1Q16658 AL122125.1-201ENST00000616999 600 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FSCN1Q16658 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FSCN1Q16658 MIR3653-201ENST00000625572 110 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FSCN1Q16658 ZNF562-201ENST00000293648 12380 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FSCN1Q16658 SMG1P4-204ENST00000523028 4131 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FSCN1Q16658 LUZP2-207ENST00000533227 5016 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
FSCN1Q16658 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
FSCN1Q16658 CLCA1-201ENST00000234701 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
FSCN1Q16658 ERGIC2-212ENST00000611644 4961 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FSCN1Q16658 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FSCN1Q16658 PRKACB-208ENST00000394839 4200 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FSCN1Q16658 OMG-201ENST00000247271 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
FSCN1Q16658 RAD51AP1-202ENST00000352618 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
FSCN1Q16658 AL157756.1-201ENST00000532515 2859 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
FSCN1Q16658 SCN3A-202ENST00000360093 9123 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FSCN1Q16658 ADNP-201ENST00000349014 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
FSCN1Q16658 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
FSCN1Q16658 OR11H4-201ENST00000315409 1082 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FSCN1Q16658 RNU6-1243P-201ENST00000364028 107 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FSCN1Q16658 NFIB-202ENST00000380924 840 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FSCN1Q16658 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FSCN1Q16658 RNU6-178P-201ENST00000384631 104 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FSCN1Q16658 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
FSCN1Q16658 RNU6ATAC34P-201ENST00000408879 121 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FSCN1Q16658 HMGB3P23-201ENST00000414981 585 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FSCN1Q16658 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FSCN1Q16658 AL451107.1-201ENST00000416310 408 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FSCN1Q16658 Z97055.1-201ENST00000419730 712 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FSCN1Q16658 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FSCN1Q16658 AL121974.1-201ENST00000437859 377 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FSCN1Q16658 AL031667.1-201ENST00000440222 725 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FSCN1Q16658 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FSCN1Q16658 RPL23AP43-201ENST00000446445 471 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FSCN1Q16658 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FSCN1Q16658 AC053481.1-201ENST00000467217 306 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FSCN1Q16658 AC002460.1-201ENST00000504394 370 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FSCN1Q16658 AC005699.1-201ENST00000510095 555 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FSCN1Q16658 AC108064.1-201ENST00000513791 460 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FSCN1Q16658 AC034159.1-201ENST00000513885 583 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FSCN1Q16658 AC016598.2-201ENST00000514942 525 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FSCN1Q16658 AC016885.1-201ENST00000517796 532 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FSCN1Q16658 TRIQK-209ENST00000519969 555 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FSCN1Q16658 AC022861.1-201ENST00000522981 663 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FSCN1Q16658 OR5M7P-201ENST00000526140 972 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FSCN1Q16658 OR5AP1P-201ENST00000529730 940 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FSCN1Q16658 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FSCN1Q16658 AC099313.1-201ENST00000568437 452 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FSCN1Q16658 AC002094.2-201ENST00000577850 1121 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FSCN1Q16658 RN7SL176P-201ENST00000580352 264 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FSCN1Q16658 AC138207.6-203ENST00000581652 565 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FSCN1Q16658 MIR4472-2-201ENST00000582069 67 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FSCN1Q16658 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FSCN1Q16658 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FSCN1Q16658 AC020634.1-201ENST00000608701 549 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FSCN1Q16658 ATXN3-251ENST00000617719 1074 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FSCN1Q16658 AC006065.6-201ENST00000625201 545 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FSCN1Q16658 OR11H4-203ENST00000641525 1082 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FSCN1Q16658 SAMMSON-213ENST00000641336 1521 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FSCN1Q16658 AP001803.2-201ENST00000532274 2034 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FSCN1Q16658 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FSCN1Q16658 AC107027.3-201ENST00000565095 3473 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FSCN1Q16658 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FSCN1Q16658 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FSCN1Q16658 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
FSCN1Q16658 NAIP-210ENST00000523981 4543 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
FSCN1Q16658 AC005832.2-201ENST00000538921 1430 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FSCN1Q16658 AC006971.1-201ENST00000407916 4486 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FSCN1Q16658 ZNF429-209ENST00000618549 1889 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FSCN1Q16658 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FSCN1Q16658 ELL2P4-201ENST00000446870 1376 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FSCN1Q16658 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FSCN1Q16658 OR6K3-201ENST00000368145 1844 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FSCN1Q16658 EYA4-202ENST00000355286 4317 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
FSCN1Q16658 DLC1-209ENST00000511869 2451 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
FSCN1Q16658 MNDA-201ENST00000368141 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
FSCN1Q16658 AC007529.1-201ENST00000418574 2178 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FSCN1Q16658 AC000374.1-201ENST00000434698 1745 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FSCN1Q16658 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FSCN1Q16658 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FSCN1Q16658 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FSCN1Q16658 AC064875.1-202ENST00000421112 561 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FSCN1Q16658 AL513174.1-201ENST00000423182 629 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FSCN1Q16658 DIAPH3-AS2-201ENST00000428656 367 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FSCN1Q16658 CEACAMP1-201ENST00000434624 1035 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FSCN1Q16658 TBX18-AS1-202ENST00000441863 382 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FSCN1Q16658 EIF4A1P11-201ENST00000451239 222 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FSCN1Q16658 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FSCN1Q16658 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FSCN1Q16658 AC117430.1-201ENST00000474711 801 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FSCN1Q16658 SLC25A15P5-201ENST00000508033 253 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FSCN1Q16658 PARP4P3-201ENST00000510265 317 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.1 ms