Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 AC087650.1-201ENST00000431445 468 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 AL138759.1-201ENST00000432120 645 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 POU6F2-AS1-201ENST00000433519 381 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 AL080313.1-201ENST00000434947 405 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 AP001432.1-201ENST00000440629 520 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 LINC00113-203ENST00000442550 572 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 AF127577.1-201ENST00000446301 562 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 RPL7P52-201ENST00000449200 742 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 LINC02045-201ENST00000460324 679 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 FTH1P2-201ENST00000466086 412 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 AC097372.3-201ENST00000503593 522 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 AC008243.1-202ENST00000506527 481 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 AC006390.1-201ENST00000508068 283 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 AC026402.1-201ENST00000513642 170 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 MTATP6P9-201ENST00000515039 680 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 AC093535.1-201ENST00000515808 747 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 RN7SKP289-201ENST00000517244 295 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 AC024958.1-201ENST00000519364 902 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 AP001636.2-201ENST00000525517 696 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 AP000462.1-201ENST00000535704 818 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 MRPL42-203ENST00000547098 701 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 AC068643.2-201ENST00000547418 852 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 AC093025.1-201ENST00000547795 569 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 AC125611.1-201ENST00000549563 229 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 AC026888.1-201ENST00000553348 559 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 AC053481.4-201ENST00000583164 216 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 AL163642.2-201ENST00000604722 1019 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 AC010738.1-201ENST00000604970 987 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 AL592436.1-201ENST00000605135 558 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 AL138478.1-201ENST00000612252 832 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 AC099654.8-201ENST00000637757 681 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 AL672296.1-201ENST00000427780 2158 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 AL645568.2-201ENST00000432815 1337 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 FEZ2-201ENST00000305852 1782 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 AC005550.3-201ENST00000451240 3743 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 CDR1-202ENST00000625883 1485 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 BDP1P-201ENST00000582658 1990 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 TRMT10A-203ENST00000394877 3516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 ADGRG2-205ENST00000357991 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 MAPK10-253ENST00000641010 4072 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 LRRTM4-201ENST00000409088 3616 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 RNA5SP97-201ENST00000365006 84 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 LANCL1-AS1-202ENST00000420418 476 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 LINC00382-201ENST00000427918 890 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 AC093581.1-202ENST00000430890 391 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 LINC00375-201ENST00000433074 601 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 ATP5HP2-201ENST00000433885 485 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
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SGCBQ16585 AL662791.1-201ENST00000441992 928 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 AL161725.2-201ENST00000442442 403 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 AL356859.1-201ENST00000449180 414 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
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SGCBQ16585 AL445669.2-201ENST00000454425 421 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 MTATP6P14-201ENST00000455189 673 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
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SGCBQ16585 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 PPIAP15-201ENST00000479662 484 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 RPS3AP6-201ENST00000484430 795 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
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SGCBQ16585 AC026719.1-201ENST00000506059 456 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 FTH1P21-201ENST00000512179 511 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 AC026412.2-201ENST00000512270 1075 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 AC108064.1-201ENST00000513791 460 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 RNU6-1225P-201ENST00000516336 65 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 RNU4ATAC6P-201ENST00000516592 126 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 RNA5SP179-201ENST00000517284 121 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 C8orf22-204ENST00000522267 739 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 TMEM68-214ENST00000523073 536 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 UTS2-201ENST00000054668 420 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 AC073655.2-202ENST00000547927 401 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 AC073525.1-202ENST00000550049 732 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 AL355773.1-201ENST00000554458 459 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 AC025917.1-201ENST00000562062 612 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 AC009101.2-201ENST00000564293 456 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 AC087481.2-201ENST00000565492 330 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 GOLGA8M-203ENST00000568033 557 ntTSL 4 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 AC010547.3-201ENST00000569271 440 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 AC133065.1-201ENST00000572017 575 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 AC005899.4-201ENST00000581915 514 ntTSL 4 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 TTN-AS1-228ENST00000589234 751 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 AC022916.3-201ENST00000592961 742 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 AC069431.2-201ENST00000604149 1099 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 TMEM212-205ENST00000619900 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 AC022306.3-201ENST00000619930 550 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
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