Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 DUXAP11-201ENST00000603858 526 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 ATXN3-251ENST00000617719 1074 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 AC008785.1-201ENST00000624475 456 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 AC009039.2-201ENST00000624524 529 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 KLHL13-208ENST00000541812 3102 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 AC015813.6-201ENST00000624409 5808 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 DDX20-202ENST00000475700 4332 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 LUZP2-207ENST00000533227 5016 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 CNOT2-231ENST00000551483 4753 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 UNC13C-201ENST00000260323 12946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 WFDC9-201ENST00000326000 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 RNU6-433P-201ENST00000363216 104 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 RNU6-723P-201ENST00000383973 107 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 CYB5AP4-201ENST00000396692 399 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 CACYBP-203ENST00000406752 243 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 AC118345.1-201ENST00000411785 366 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 RSU1P3-201ENST00000412878 835 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 AL591848.1-201ENST00000413092 322 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 AC107081.1-201ENST00000414975 361 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 RAD23BP1-201ENST00000421404 1227 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 AL360081.1-201ENST00000428299 555 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 AC010975.1-201ENST00000443301 669 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 HMGB1P36-201ENST00000487709 576 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 AC105233.1-201ENST00000498840 781 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 AC096751.1-202ENST00000502691 1067 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 AC025554.1-201ENST00000505641 188 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 LINC02465-201ENST00000507099 532 ntTSL 4 BASIC4.68□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 AC018752.1-201ENST00000507813 206 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 AC093809.1-201ENST00000509155 340 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 LTV1P1-201ENST00000510683 1237 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 AC008780.1-201ENST00000513392 409 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 LINC02484-201ENST00000513843 546 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 AC079209.1-201ENST00000519412 820 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 OR5AP1P-201ENST00000529730 940 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 LINC02390-201ENST00000541404 560 ntTSL 4 BASIC4.68□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 AC091515.1-201ENST00000548110 679 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 AC013437.1-201ENST00000549878 414 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 AL352979.3-201ENST00000553515 247 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 AL355073.1-201ENST00000560296 517 ntTSL 4 BASIC4.68□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 AC145350.1-201ENST00000567426 208 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 AC135050.5-201ENST00000576336 543 ntTSL 4 BASIC4.68□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 AC087399.1-201ENST00000579769 573 ntTSL 4 BASIC4.68□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 AC008751.2-201ENST00000597885 980 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 AC100827.5-201ENST00000615883 426 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 CT45A10-202ENST00000617981 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 CT45A7-202ENST00000620885 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 AC019278.1-201ENST00000623516 479 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 AP003485.2-201ENST00000623636 610 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 AC012593.1-212ENST00000627058 580 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 ARHGAP42-203ENST00000524892 5685 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 CACNB4-233ENST00000636773 4143 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 AL442639.1-201ENST00000625030 1899 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 MAPK10-263ENST00000641052 4307 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 LMNTD1-204ENST00000458174 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 DMXL2-202ENST00000449909 7465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 TMEM38B-201ENST00000374688 3956 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 RIMS1-204ENST00000401910 3542 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 ZNF962P-201ENST00000443465 3140 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 DEFB129-201ENST00000246105 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 AC007685.1-201ENST00000329806 452 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 KLRF1-202ENST00000354855 838 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
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BRD3Q15059 SNORD3H-201ENST00000384486 214 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 RNA5SP113-201ENST00000410486 84 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 RN7SKP100-201ENST00000411258 284 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 LINC01048-201ENST00000414480 511 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 GNG12-AS1-202ENST00000414904 796 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 NRBF2P3-201ENST00000432731 865 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 AL135787.1-201ENST00000450154 302 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 OR6C5P-201ENST00000452388 923 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
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BRD3Q15059 AC068587.2-201ENST00000478386 781 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 RPS3AP22-201ENST00000488297 769 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 AC026991.1-201ENST00000520815 463 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 AP002765.2-201ENST00000532961 666 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 AP006289.1-201ENST00000538089 277 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 VN1R79P-201ENST00000593540 513 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 AC024563.1-202ENST00000597533 419 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
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