Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 AC087241.1-201ENST00000508615 429 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NFIXQ14938 SNORA31.13-201ENST00000516624 135 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NFIXQ14938 IGHV3-32-201ENST00000519182 355 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NFIXQ14938 MAL2-205ENST00000521048 575 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NFIXQ14938 AC138832.1-201ENST00000522871 556 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NFIXQ14938 AP000859.1-201ENST00000525536 307 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NFIXQ14938 AC023796.1-201ENST00000536131 670 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NFIXQ14938 AL392023.2-202ENST00000555342 494 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NFIXQ14938 NDUFB1-204ENST00000555441 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NFIXQ14938 TVP23BP1-201ENST00000557500 617 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NFIXQ14938 AC012404.1-201ENST00000560876 476 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NFIXQ14938 AC024267.4-202ENST00000582631 436 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NFIXQ14938 AP001029.2-202ENST00000588197 739 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NFIXQ14938 RPL7P50-201ENST00000600588 727 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NFIXQ14938 LINC00907-211ENST00000601948 795 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NFIXQ14938 BPIFA4P-203ENST00000603168 689 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NFIXQ14938 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NFIXQ14938 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NFIXQ14938 AP004607.9-201ENST00000618202 316 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NFIXQ14938 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NFIXQ14938 CDRT1-208ENST00000630868 794 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NFIXQ14938 COPG2-201ENST00000330992 3073 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
NFIXQ14938 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NFIXQ14938 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
NFIXQ14938 OR7A5-201ENST00000322301 4216 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NFIXQ14938 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
NFIXQ14938 RLIMP2-201ENST00000427891 1563 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NFIXQ14938 NAIP-210ENST00000523981 4543 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
NFIXQ14938 ZC3H12B-201ENST00000338957 7256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
NFIXQ14938 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NFIXQ14938 RAB23-201ENST00000317483 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
NFIXQ14938 STARD4-201ENST00000296632 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NFIXQ14938 RAD51AP1-202ENST00000352618 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
NFIXQ14938 AC011912.1-201ENST00000623483 5819 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
NFIXQ14938 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NFIXQ14938 SLCO1C1-208ENST00000545102 2868 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NFIXQ14938 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
NFIXQ14938 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NFIXQ14938 RNU6-1122P-201ENST00000384449 107 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NFIXQ14938 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NFIXQ14938 RN7SKP285-201ENST00000410137 318 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NFIXQ14938 AC009237.10-201ENST00000414112 510 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NFIXQ14938 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NFIXQ14938 AC119800.1-201ENST00000429871 423 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NFIXQ14938 TMX2P1-201ENST00000436507 708 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NFIXQ14938 RPS4XP4-201ENST00000443195 763 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NFIXQ14938 AC104651.2-201ENST00000447549 528 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NFIXQ14938 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NFIXQ14938 DDX39BP2-208ENST00000453923 258 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NFIXQ14938 AC123768.1-201ENST00000486285 432 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NFIXQ14938 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NFIXQ14938 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NFIXQ14938 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NFIXQ14938 PDCD5P1-201ENST00000543528 309 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NFIXQ14938 AC068643.2-202ENST00000552759 622 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NFIXQ14938 AL445363.1-202ENST00000553697 545 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NFIXQ14938 AC110023.1-201ENST00000554318 457 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NFIXQ14938 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NFIXQ14938 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NFIXQ14938 MMP2-AS1-201ENST00000565307 593 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NFIXQ14938 AC003009.1-201ENST00000571611 686 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NFIXQ14938 RN7SL703P-201ENST00000578485 302 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NFIXQ14938 MIR7515HG-213ENST00000585872 758 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NFIXQ14938 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NFIXQ14938 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NFIXQ14938 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NFIXQ14938 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NFIXQ14938 MIR6875-201ENST00000617506 72 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NFIXQ14938 AC145207.9-201ENST00000623802 325 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NFIXQ14938 AJ009632.2-203ENST00000634708 1205 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NFIXQ14938 AF001550.2-201ENST00000636643 217 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NFIXQ14938 PCDH15-211ENST00000395440 3177 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NFIXQ14938 TCN1-201ENST00000257264 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
NFIXQ14938 ZNF33A-202ENST00000374618 6122 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NFIXQ14938 ARHGAP21-218ENST00000636789 4210 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NFIXQ14938 GUCY1A3-201ENST00000296518 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
NFIXQ14938 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
NFIXQ14938 PHACTR2-207ENST00000427704 9531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
NFIXQ14938 LINC01619-207ENST00000551843 2205 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
NFIXQ14938 AC000367.1-201ENST00000452711 1766 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NFIXQ14938 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NFIXQ14938 AC092162.3-201ENST00000624511 1624 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NFIXQ14938 MTX3-204ENST00000617335 6155 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NFIXQ14938 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NFIXQ14938 CNTN1-202ENST00000348761 3328 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
NFIXQ14938 HTN1-201ENST00000246896 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
NFIXQ14938 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NFIXQ14938 RNU6-666P-201ENST00000363499 107 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NFIXQ14938 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NFIXQ14938 RNA5SP130-201ENST00000364431 114 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NFIXQ14938 RNA5SP513-201ENST00000364648 118 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NFIXQ14938 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NFIXQ14938 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NFIXQ14938 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NFIXQ14938 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NFIXQ14938 RNU4-31P-201ENST00000384211 141 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NFIXQ14938 RNU6-532P-201ENST00000384318 107 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NFIXQ14938 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NFIXQ14938 MIR142-201ENST00000384835 87 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NFIXQ14938 AL080315.1-201ENST00000406055 466 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.6 ms