Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 AC090403.1-204ENST00000582893 572 ntTSL 4 BASIC4.38□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 ZNF667-AS1-207ENST00000592146 668 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 PRKCQ-AS1-207ENST00000607996 531 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 PACRG-210ENST00000611387 279 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 AC015712.7-201ENST00000615211 635 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 ZNF788-203ENST00000430298 3941 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 LINC01619-207ENST00000551843 2205 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 ZNF573-217ENST00000590414 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 KCNJ10-205ENST00000638728 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 DMTF1-204ENST00000413276 3548 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 DYTN-201ENST00000452335 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 AL121950.1-201ENST00000624993 2077 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 CASC1-202ENST00000354189 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 PPEF1-202ENST00000361511 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 ZNF645-201ENST00000323684 1519 ntAPPRIS P1 BASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 GPR87-201ENST00000260843 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 RPL23AP57-201ENST00000332361 466 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 RNA5SP132-201ENST00000364725 118 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 TRAV23DV6-201ENST00000390451 409 ntAPPRIS P1 BASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 AL009179.1-201ENST00000406085 265 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 Z93019.1-201ENST00000416450 973 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 AL359853.3-201ENST00000423879 544 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 AL731563.2-201ENST00000431293 291 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 AC009226.1-201ENST00000432413 539 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 PRPF38AP2-201ENST00000438179 851 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 AP001434.1-201ENST00000444977 287 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 LINC01729-201ENST00000450640 358 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 AL645937.3-201ENST00000453647 936 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
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FOXE3Q13461 RN7SL583P-201ENST00000475692 287 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
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FOXE3Q13461 CDV3-208ENST00000511392 554 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 AC017037.2-201ENST00000513850 890 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
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FOXE3Q13461 RNA5SP228-201ENST00000516232 133 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 SUMO2P20-201ENST00000520803 283 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 AC008562.1-201ENST00000521763 330 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
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FOXE3Q13461 OR4T1P-201ENST00000554933 911 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
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FOXE3Q13461 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 LINC01835-202ENST00000589345 450 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 MAPKAPK5-AS1-205ENST00000590479 543 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 AC063952.1-204ENST00000635496 927 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 AC079776.5-201ENST00000641920 211 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 DOCK10-202ENST00000409592 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 RALGAPA1P1-201ENST00000443361 6232 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 CD36-221ENST00000534394 1741 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 DCN-202ENST00000393155 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 PALMD-201ENST00000263174 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 FAM114A2-210ENST00000520313 1394 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 AC138409.2-201ENST00000514048 5001 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 MYCT1-201ENST00000367245 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
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