Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 ADGRL2-206ENST00000370721 5023 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 SLC35A5-206ENST00000492406 4399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 FHL1-218ENST00000543669 2878 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 AC138915.3-201ENST00000562908 1389 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 OR52E5-201ENST00000610445 2244 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 AC024560.2-201ENST00000507981 1497 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 USP26-203ENST00000511190 3665 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 PARD3B-214ENST00000622699 7442 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 RYR3-209ENST00000634418 15078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 AC092326.2-201ENST00000624772 1561 ntBASIC6.52□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 MCF2L2-202ENST00000414362 3031 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 LINC02456-201ENST00000635615 1323 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 KDM4C-214ENST00000536108 3406 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 VNN2-201ENST00000326499 2118 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 LINC00598-206ENST00000615947 3541 ntTSL 4 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 AL121839.2-201ENST00000565058 6943 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 RNA5SP372-201ENST00000390836 115 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 ARF4P3-201ENST00000397387 509 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 JKAMPP1-201ENST00000413804 919 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 USP24P1-201ENST00000433802 779 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 MACROD2-IT1-201ENST00000448536 665 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 GLUD1P3-202ENST00000508551 200 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 AC078814.2-201ENST00000552996 535 ntTSL 4 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 AL049779.1-201ENST00000553306 670 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 AC011468.4-201ENST00000603942 409 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 ARF4P1-201ENST00000605447 541 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 AC055876.5-201ENST00000605667 259 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 AC023813.4-201ENST00000607580 580 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 PLS1-211ENST00000497002 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 XPOTP1-201ENST00000443317 2398 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 AL359955.1-201ENST00000455242 3275 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 CYP2C8-210ENST00000535898 1799 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 HACD3-209ENST00000566511 1782 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 AC026523.1-202ENST00000559363 1401 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 OR56B2P-202ENST00000641377 2453 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 MTX3-204ENST00000617335 6155 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 SLC30A7-201ENST00000357650 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 RPS26P8-201ENST00000393490 348 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 AL590762.2-201ENST00000395798 571 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 RPL7P25-201ENST00000404151 721 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 AL603766.1-201ENST00000407763 664 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 FAM230B-202ENST00000415704 396 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 TEX41-204ENST00000423031 491 ntTSL 4 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 RPEP3-201ENST00000425462 676 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 AC008728.1-201ENST00000512730 691 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 AC099520.1-208ENST00000518276 472 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 AC134043.1-201ENST00000521204 638 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 AC090809.1-201ENST00000524132 570 ntTSL 4 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 OR5BC1P-201ENST00000529327 739 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 AP001781.1-201ENST00000530977 207 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 DAZAP2-209ENST00000549732 601 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 AC126323.3-201ENST00000565136 564 ntTSL 4 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 CTSLP2-203ENST00000628708 493 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 MUC12-206ENST00000536621 16321 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 MAPK10-208ENST00000395169 4049 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 ORC4-216ENST00000540442 6472 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SF3B2Q13435 IL1RL1-201ENST00000233954 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
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