Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 AL031736.2-201ENST00000426573 787 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 HNRNPA1P18-201ENST00000433537 927 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 RPS17P8-201ENST00000434525 335 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 OR3D1P-201ENST00000438288 955 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 AC108488.1-202ENST00000439547 482 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 AP006222.1-205ENST00000450734 457 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 AC010733.1-201ENST00000451515 401 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 RPS27AP1-201ENST00000475545 471 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 RN7SL193P-201ENST00000491708 276 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 CEACAMP10-202ENST00000495431 496 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 AL136038.1-201ENST00000497246 351 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 AC083906.1-201ENST00000509298 406 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 SCARNA18.1-201ENST00000516330 83 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 AP001208.1-201ENST00000518612 408 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 AF233439.1-201ENST00000526235 401 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 RPA2P3-201ENST00000533268 770 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 LINC02411-203ENST00000546180 959 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 AC040977.1-201ENST00000573222 343 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 MIR4489-201ENST00000578869 62 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 RNA5SP440-201ENST00000612665 119 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 RN7SL787P-201ENST00000613000 284 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 C1orf195-202ENST00000625027 441 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 PCBP1-AS1-282ENST00000625783 826 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 CSDE1-205ENST00000438362 4167 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 NUMB-204ENST00000535282 3198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 MYBPC1-223ENST00000553190 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 CHD6-203ENST00000373233 10818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 NFIA-201ENST00000357977 3200 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 VPS39-202ENST00000348544 2661 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 SEM1-202ENST00000356686 2667 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 BDNF-211ENST00000439476 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 IGF2BP2-AS1-202ENST00000456447 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 ADAM20-201ENST00000256389 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 RBMS3-202ENST00000383766 2757 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
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CLN3Q13286 ZSCAN12-202ENST00000396827 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
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CLN3Q13286 BICRAL-202ENST00000394168 6515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
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CLN3Q13286 OR6E1P-201ENST00000414424 923 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 AC069213.2-201ENST00000420238 366 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
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CLN3Q13286 NOTCH2P1-201ENST00000443481 624 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
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CLN3Q13286 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 AC034195.1-203ENST00000455703 728 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 CYCSP34-201ENST00000458172 304 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 OARD1-207ENST00000468811 819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 AC124945.1-201ENST00000485133 188 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 RN7SL561P-201ENST00000488553 281 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 AC090958.1-201ENST00000511122 351 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 LINC02432-203ENST00000511213 719 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 ATP5LP3-201ENST00000514223 304 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 IGKV2-19-201ENST00000518132 283 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 AC018442.3-201ENST00000523025 183 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 SOX9-AS1-208ENST00000529667 340 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 LINC02306-201ENST00000546412 529 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 AP005431.1-201ENST00000618479 319 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 PIGX-210ENST00000639143 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CLN3Q13286 AC079776.5-201ENST00000641920 211 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
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