Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 OR52E4-202ENST00000641726 2947 ntAPPRIS P1 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 FAM126B-202ENST00000418596 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 NFIB-211ENST00000606230 2311 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 BPY2-202ENST00000382585 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 RNU6-83P-201ENST00000384568 112 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 SNORD96B-201ENST00000386148 79 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 PPIAP31-201ENST00000405422 495 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 HDGFP1-201ENST00000405943 252 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 Z85994.1-201ENST00000406912 606 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 MIR1183-201ENST00000408856 89 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 SUMO1-205ENST00000409205 534 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 AC092484.1-201ENST00000420548 833 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 AL389915.1-201ENST00000422463 466 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 AC019178.2-201ENST00000423595 505 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 MTCO2P17-201ENST00000424336 677 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 RPL7P2-201ENST00000427639 268 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 AC073335.1-201ENST00000427776 363 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 COX6B1P7-201ENST00000430845 235 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 DMD-AS3-201ENST00000439592 293 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 MTND3P1-201ENST00000441336 220 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 AL512326.1-201ENST00000443050 721 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 Z73417.1-201ENST00000447373 778 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 AL162151.2-201ENST00000448875 158 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 MTND2P19-201ENST00000449129 1012 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 NECTIN3-AS1-202ENST00000467426 664 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 RPL35AP15-201ENST00000468042 339 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 RPL23AP65-201ENST00000475608 468 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 AL132838.2-201ENST00000492041 314 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 RN7SL691P-201ENST00000494487 301 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 AC106821.1-201ENST00000502861 572 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 AC093853.1-201ENST00000515689 483 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 LINC01216-201ENST00000515728 824 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 OR5AK1P-201ENST00000524837 922 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 CBX3P5-201ENST00000552017 521 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 MMP2-AS1-201ENST00000565307 593 ntTSL 4 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 AC006130.2-201ENST00000586202 326 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 AC011524.1-201ENST00000590167 240 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 AL391001.1-201ENST00000602747 715 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 AL451044.1-201ENST00000604867 238 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 AC010201.1-201ENST00000605051 540 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 AC006270.3-201ENST00000605967 1036 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 AL590282.1-201ENST00000610379 1136 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 BPY2B-204ENST00000615850 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 MIR6875-201ENST00000617506 72 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 BPY2C-204ENST00000618574 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 VPS29-212ENST00000621131 1124 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 AL359313.1-202ENST00000635073 544 ntTSL 4 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 COPS2-202ENST00000388901 6628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 RC3H2-203ENST00000373670 9248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 AC005539.1-201ENST00000443768 1479 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 ANKRD28-215ENST00000624145 6383 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 MARCH1-201ENST00000274056 5367 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 SAMSN1-201ENST00000285670 2185 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 MARK2P15-201ENST00000432204 2186 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 LINC02471-203ENST00000641941 4752 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CHAF1BQ13112 DAZ4-206ENST00000449750 3271 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 BRCA2-201ENST00000380152 11986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 NCOA1-203ENST00000395856 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 CNOT2-231ENST00000551483 4753 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 MS4A14-208ENST00000531783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 EEF1A1P42-201ENST00000613436 1331 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 AC007685.1-201ENST00000329806 452 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 RNA5SP130-201ENST00000364431 114 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 PMS1-202ENST00000374826 948 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 AL138749.1-201ENST00000397864 791 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 AC010163.2-201ENST00000416341 381 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 AL356095.1-201ENST00000417217 199 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 AC005828.1-201ENST00000431604 524 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
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CHAF1BQ13112 AC091212.1-201ENST00000474798 395 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 AL365356.5-201ENST00000478294 697 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 RPL7P18-201ENST00000478965 734 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 RN7SL817P-201ENST00000480777 288 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 AC108022.1-201ENST00000493466 478 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 AC092045.1-201ENST00000495716 1231 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 RPS27AP13-201ENST00000498403 237 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 AC093895.1-203ENST00000506814 591 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 AC022118.1-201ENST00000512352 547 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 AC010255.3-204ENST00000514637 454 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 RN7SKP265-201ENST00000516448 223 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 AC084768.1-201ENST00000518926 923 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 TPT1-AS1-216ENST00000522845 403 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 AC022861.1-201ENST00000522981 663 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 RGS5-218ENST00000526176 574 ntTSL 4 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 DEFB131D-201ENST00000526803 184 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 IFNG-AS1-201ENST00000536914 494 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 LINC02131-201ENST00000563289 419 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 AC087481.2-201ENST00000565492 330 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
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